张志杰，田 良

（武汉市红十字会医院泌尿外科，武汉 430015）

据估计，全世界新发膀胱癌病例可高达55万例/年[1]。在未发生肿瘤转移的情况下，膀胱切除术是治疗膀胱癌的首选方法。然而，膀胱癌术后的复发率可高达17%[2]。近年来，恶性肿瘤的免疫疗法引起广泛关注。肿瘤微环境与临床疗效和预后存在一定关联，而免疫细胞浸润影响了肿瘤微环境[3]。有研究认为，利用免疫细胞浸润的生物学特点及其与临床结果的相关性，可开发出潜在的肿瘤治疗靶点[4]。本研究基于公共数据库癌症基因组图谱（the cancer ge⁃nome atlas,TCGA）数据库，对膀胱癌患者的基因表达和临床数据进行相关性分析，以期提高临床膀胱癌患者的生存机率。

1 资料与方法

1.1 数据来源在TCGA网站（https://cancergenome.nih.gov/）中搜索与膀胱癌基因表达相关数据，总共纳入符合条件的样本433例，其中包含膀胱癌组织414例、正常膀胱组织19例，除肿瘤数据之外，还下载了412例样本的年龄、性别、临床分期、肿瘤分级和生存状态等相关临床数据。

1.2 数据处理方法

1.2.1 免疫细胞浸润组成运算 应用Perl软件和Cibersort（（http://cibersort.stanford.edu/））进 行 基 于mRNA-seq的细胞类型反卷积运算，将mRNA-seq数据作为每千个碱基的转录每百万映射读取的片段数（FPKM）值进行处理，矫正RNA表达谱，并通过“edg⁃eR”软件包进行差异基因分析。下载系列矩阵文件后，使用R中的“limma”软件包对原始数据进行了归一化。本研究计算了Cibersort提供的22种肿瘤浸润性免疫细胞的比例，筛选标准为P＜0.05。在矩阵中，每个样品中所有免疫细胞的总数等于100%。通过“heatmap”程序包在热图中显示22个免疫细胞的分布，并通过“corrplot”程序包计算免疫细胞之间的相关性。……