基于DIA LC-MS对III期食管鳞癌和食管良性疾病患者外周血外泌体差异蛋白的研究①
2021-06-24阿尔孜古丽吐尔逊杨丽菲郑树涛张琪琪韩秀娟卢晓梅
阿尔孜古丽·吐尔逊,杨丽菲,郑树涛,,刘 清,,刘 涛,4,张琪琪,韩秀娟,卢晓梅,
(1新疆医科大学临床医学研究院,2新疆医科大学附属肿瘤医院肺内科一病区,3省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室,乌鲁木齐,830011;4新疆医科大学第一附属医院检验科,乌鲁木齐 830054)
食管癌(esophageal cancer,EC)仍是我国常见的消化系统恶性肿瘤[1]。食管癌组织学类型分为食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)和食管腺癌(adenocarcinoma of the esophagus,EADC),前者占我国所有食管癌患者的90%[2]。
由于食管癌起病隐匿,初诊时多数患者因处于中、晚期而失去手术治疗机会,因而五年生存率约为15%~25%[3]。外泌体是一类细胞自主释放、大小统一、直径在30~150 nm的微型小泡,研究发现外泌体在肿瘤转移的多阶段中均发挥重要作用[4]。因此,从外泌体层面了解ESCC发生发展机制进而指导临床治疗与干预有着重要现实意义。随着医学技术的迅猛发展,蛋白质组学已成为研究高通量复杂蛋白的主流工具。而采用数据非依赖性采集高分辨率色谱-质谱技术(data independent acquisition liquid chro⁃matography-mass spectrometry,DIA LC-MS)研究ES⁃CC患者外周血外泌体组学的研究较少,因此本研究采用DIA LC-MS技术分析ESCC患者及食管良性疾病患者外周血外泌体蛋白图谱,并通过生物信息学技术找出差异蛋白并进行分析,从而揭示食管癌发生发展的分子分型调控机制,为该病的早期诊断和后期治疗提供数据基础及策略。
1 材料与方法
1.1 研究对象本研究通过新疆医科大学附属肿瘤医院医学伦理委员会批准(K-2019054),标本的获取征得患者知情同意。用于外泌体蛋白质组学的分析样本包括3例III期ESCC患者和3例食管良性疾病患者,ESCC患者均为溃疡型,食管良性疾病患者均为食管平滑肌瘤患者,上述人群无糖尿病且均行手术治疗并通过手术后病理明确分期。……
