2株毒力不同M.bovis 差异表达蛋白的定量检测及分析
2021-06-19李梦莹董玉惠马小静张淮瑜宋阿北周向梅许立华
李梦莹,田 帅,董玉惠,马小静,张淮瑜,宋阿北,周向梅,许立华
(1.宁夏大学农学院,宁夏 银川 750021 ; 2.中国农业大学动物医学院,北京 海淀 100193)
蛋白组学技术串联质谱标记(Tandem mass tag,TMT)与液相色谱质谱联用(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)相结合是一种基于标记定量的新技术,可以对多个样品进行蛋白质和多肽的定量分析[1]。TMT是定量蛋白质组学中最常用的同位素标记方法,它对蛋白质的相对表达量提供了准确性和可重复性。该方法可对鉴定的蛋白质进行相互验证,为牛分枝杆菌(Mycobacteriumbovis,M.bovis)的毒力蛋白以及致病性提供依据。
M.bovisC68004菌株是20世纪50年代从1头患有结核病的牛组织中分离得到,M.bovisN菌株是2015年从具有典型全身性结核病症状的犊牛大脑中分离出来。程广宇等对这2株细菌在小鼠模型上的致病性进行了研究,发现M.bovisN感染的小鼠肺部和脾脏的病变程度比M.bovisC68004感染的小鼠更为严重[2]。然而,仍然不清楚这2个菌株的毒力因子差异,以及它们在激发宿主免疫反应的不同是否与其蛋白表达差异有关。因此,本试验将2株牛分枝杆菌进行蛋白组学分析,找出差异表达蛋白,并分析这些差异蛋白对其致病性及毒力的影响。
1 材料与方法
1.1 菌株M.bovis(菌株号:C68004菌和N菌)由中国农业大学国家动物海绵状脑病实验室保存。
1.2 方法
1.2.1 细菌培养与制备 2株菌株均在添加10% OADC(油酸、牛血清蛋白V、右旋糖、过氧化氢酶)和1% Tween80的Middlebrook 7H9(BD Biosciences公司)液体培养基中培养。细菌OD值为0.6~0.8,3 000~5 000 g离心5~15 min,去上清,PBS洗涤沉淀3次,液氮速冻,菌体-80 ℃保存。
1.2.2 蛋白样品制备方法(匀浆裂解法[3]) 取菌体沉淀加入适量SDT裂解液,转移至预先装有适量石英砂(组织样品另外加入1颗1/4英寸陶瓷珠)的2 mL离心管中,用美国MP匀浆仪进行匀浆破碎(24 s×2,6.0 m/s,60 s,2次)。……
