基于TCGA数据库构建肝细胞癌中RNA结合蛋白预后评估模型
2021-06-10杨文娟马青梅张娇弟马梦婷刘欣跃
杨文娟, 马 莉, 马青梅, 李 婧, 张娇弟, 马梦婷, 张 倩, 刘欣跃
兰州大学第二医院检验医学中心,甘肃 兰州 730030
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是一种常见的原发性肿瘤,占原发性肝癌的85%~90%,严重影响全球人民的健康。2018年世界卫生组织的癌症统计报告显示,在十大癌症中,HCC的发病率居第六位,死亡率居第四位,且男性高于女性[1]。我国癌症流行病学数据显示,2014年和2015年HCC的新发病例数分别为36.5万、37.0万,死亡病例数分别为31.8万、32.6万,表明我国HCC的诊治并未取得较好的效果,这与HCC的病因和致病机制不明有着重要的联系[2-3]。HCC的筛查关键是早发现、早诊断、早治疗,且多部指南推荐的筛查方法为肝脏超声和血清甲胎蛋白(AFP),但该筛查方法仅推荐用于肝硬化、病毒性肝炎、过度饮酒、长期食用含黄曲霉毒素的食物、非酒精性脂肪性肝病等高风险人群[4-8]。由于筛查手段的适用人群具有一定的局限性,使得部分患者未能及时确诊而错过最佳的手术期和化疗期[9]。此外,发现常用的索拉非尼、仑伐替尼和系统化疗等可能引起腹泻、高血压和肝肾毒性等不良反应。因此,有必要探索HCC的生物学标志物,帮助HCC患者的早期诊断、早期治疗,研发安全性更高的化学治疗药物,延长患者的生存时间。
随着RNA测序技术的发展,RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)被发现是一种重要的转录后调控因子[10-11]。RBPs包括mRNA、lncRNAs、miRNAs和rRNAs等,参与剪接、修饰、转运、稳定性、定位和翻译等一系列生物学过程[12]。目前,已经发现超过1 500种RBPs,然而只有小部分RBPs的功能得到了研究[13]。研究[14]表明,包括癌症在内的各种疾病与RBPs的表达异常有着密切联系。……
