油茶叶绿体基因组特征及其系统分类*
2021-06-07周安佩陈曦颜梁坚坤
九江学院学报(自然科学版) 2021年1期
关键词:物种
周安佩 陈曦颜 梁坚坤
(1九江学院江西油茶研究中心 江西九江 332000;2江西农业大学园林与艺术学院 江西南昌 330000;3凯里学院建筑工程学院 贵州凯里 556011)
山茶属是山茶科中种类最多的一个属,共约20个组超280种[1]。中国是山茶属植物的主要富集区域,包含4个亚属(茶亚属、山茶亚属、原始山茶亚属、后生山茶亚属)238个种,其属内许多植株具有较高的观赏和经济价值[1-3]。油茶是山茶属中具有生产价值的油用物种的统称,是世界四大木本油料植物之一,油茶种子的不饱和脂肪酸达90%以上,其中油酸含量约80%,亚油酸8%,高于目前市场中其他常见食用油,是世人所公认为优质的食用油之一[4-6]。然而,油茶的系统进化关系尚不明确,仅依赖于形态学特征确定其进化关系。
叶绿体为植物特有的细胞器,内含一个双链共价闭合环状DNA(Chloroplast DNA,cpDNA),但缺乏组蛋白包裹和超螺旋结构[7-8]。cpDNA由一个长单拷贝序列(LSC)、短单拷贝序列(SSC),以及连接他们的两个反向重复序列(IRa和IRb)构成,尽管cpDNA大小不同,但基因组结构十分保守,所含基因的数目差异较小[9-10]。早期利用叶绿体若干基因片段作为植物分类的条形码,可作为科及以上分类单元的有效分类工具,而以整个叶绿体基因组作为植物分类的超级条形码,已逐渐应用于属和种的分子辅助分类[11-12]。基于此,该研究利用普通油茶DNA全基因组高通量测序数据组装成完整的叶绿体基因组,解析其基因组特征,并构建山茶属的叶绿体基因组进化树,探讨油茶的系统分类位置。……
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