我国部分地区新型鹅星状病毒ORF2基因序列及遗传变异分析
2021-06-05张思远卢秀娴梁昭平林举攀
张思远,卢秀娴,梁昭平,林举攀,黄 芬
(1.华南农大生物药品有限公司,广东广州 510300;2.华南农业大学,广东广州 510642)
鹅星状病毒(goose astroviruses,GoAstV)是近年危害我国养鹅业的重要病毒性传染病病原之一[1]。GoAstV感染主要发生于3周龄以内的小鹅,导致其出现食欲下降、精神萎靡、脚软等临床症状,以及肾脏等内脏组织及关节腔发生白色尿酸盐沉积,死亡率较高,可达50%[2]。星状病毒(astroviruses,AstV)1975年首次被发现,是一种单股正链RNA病毒,无囊膜[3],存在于多种动物体内,对其感染宿主既有种属特异性,也具有跨种间传播能力,对新宿主、新环境适应能力很强[4]。不同种属的AstV基因组间长度差异较大,全长6.1~7.9 kb,含有5'端未翻译区(untranslation region,UTR)、3个开放性阅读框(ORF1a、ORF1b和ORF2)、3'UTR及多聚腺苷酸(PolyA)尾[5]。不同种属AstV的3个ORFs中变异性最大的是ORF2,内部容易出现氨基酸突变[6]。
近年来,我国部分地区商品雏鹅群陆续发生高度致死性内脏痛风病,其中AstV感染是主要病因之一,给养鹅业造成了巨大经济损失。为进一步了解我国GoAstV的遗传变异方向,对2019年山东、江苏、广东、安徽等省份分离到的10株新型GoAstV进行ORF2基因序列测定及遗传进化分析,以期为该病防治提供流行病学数据,为深入研究该病致病特点奠定基础。
1 材料与方法
1.1 病毒
毒株由华南生物公司动物疫病诊断中心实验室从山东、江苏、广东、安徽等省份发病鹅病料中分离,经RT-PCR鉴定为新型GoAstV。其中:AstV/Goose/GD35/2019、AstV/Goose/GD776/2019分离自广东省,AstV/Goose/JS166/2019、AstV/Goose/JS343/2019、AstV/Goose/JS376/2019、AstV/Goose/JS944/2019分离自江苏省,AstV/Goose/SD534/2019、AstV/Goose/SD1008/2019分离在山东 省,AstV/Goose/AH605-1/2019、AstV/Goose/AH605-2/2019分离自安徽省。
1.2 主要试剂及仪器
核酸自动提取试剂盒,购自天隆公司;pMD19-T载体、DL 2 000 DNA Marker,购自TAKARA公司;……
