崔正彩 孔凡娜茅云翔, 2 孙 斌 王俊皓 董道英

条斑紫菜和基因家族鉴定及失水胁迫表达模式分析*

崔正彩1孔凡娜1①茅云翔1, 2孙 斌1王俊皓1董道英1

(1. 中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003; 2. 海南热带海洋学院水产与生命学院 热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室 三亚 572022)

微管是细胞骨架的主要成分, 其结构及动力学机制对提高生物体耐受性具有重要作用。微管网络如何通过结构的动态变化调控适应环境变化已成为胁迫生物学领域的研究热点之一。条斑紫菜()能够适应潮间带复杂多变的环境, 是研究潮间带大型海藻抗逆机制的良好材料。目前对紫菜微管相关基因家族构成及其生物学功能的研究较少。本研究利用生物信息学方法, 在条斑紫菜基因组中共鉴定出4个基因(、、和)和11个基因(—), 并对其理化性质、基因结构、蛋白特征、染色体定位、系统进化和失水胁迫下的表达模式进行了系统分析。结果显示: 条斑紫菜中有3种微管蛋白(Tubulin)亚型; 该家族成员散布于1号和2号染色体上,和为串联重复基因;家族成员在基因结构和蛋白特征方面均较为保守, 且在转录水平对失水胁迫不敏感。条斑紫菜中有5种驱动蛋白(Kinesin)亚型, 亚家族种类和基因数量均少于高等植物; 该家族基因散布于1号、2号和3号染色体上, 无串联重复基因;家族成员在基因结构和蛋白特征方面存在一定差异,在中高度失水胁迫下表达量显著上调。……