徐鸿飞，陈 诏*，黄彩林，袁宗伟，赵何勇，李 华，杨宾兰，周大颜，苏换换，朱华平

(1.广西壮族自治区水产引育种中心，广西 南宁 530031；2.中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广东 广州 510380)

【研究意义】红罗非鱼(Red tilapia，Oreochromisspp.)隶属于鲈形目丽鱼科，由罗非鱼属间杂交选育获得，其体色是由色素细胞分泌的色素及遗传、环境、营养和生理等多种因素共同作用的结果。红罗非鱼肉质细嫩、营养丰富[1-2]，体色艳丽，无肌间刺且腹腔无黑膜，近年来深受消费者青睐，在我国和东南亚等国家的养殖面积不断扩大[3]。但在遗传育种和越冬过程中，红罗非鱼的肤色会发生变异，进而制约了其养殖产业的良性发展[4]。简化基因组测序(RAD-Seq)因具有酶切DNA片段大小一致、文库构建简单快速、标签密度易于调节、成本低廉和准确性高等优点已得到广泛应用[5]；而全基因组关联分析(GWAS)在揭示复杂性状的数量遗传变异规律、解析关键基因的遗传调控机制及推动分子辅助育种等方面具有广阔前景[6-9]。因此，基于RAD-Seq和GWAS技术分析红罗非鱼低温体色变异的分子机制，筛选出与体色变异相关的分子标记，对扩大我国红罗非鱼养殖规模及提升其养殖效益具有重要意义。【前人研究进展】传统的遗传育种主要根据不同表型性状直接进行选择[10]，是一个耗时费力的繁杂过程。随着分子生物学和基因组学的发展，鱼类遗传育种研究正经历由传统选择育种、杂交育种到基于基因组信息分子育种的转变[11-12]。……