基于Hadoop_8的新疆棉田土壤微生物资源大数据平台建设与可视化分析
2021-05-24刘海燕侯彤瑜姚兆群王海江
农业大数据学报 2021年1期
刘海燕 杨 榕 侯彤瑜 赵 维 姚兆群 王海江 张 泽 高 攀 吕 新*
(1.新疆兵团农业大数据国家地方联合工程研究中心,石河子 832000;2.石河子大学信息科学与技术学院,石河子 832000;3.石河子大学农学院/新疆绿洲农业病虫害治理与植保资源利用重点实验室,石河子 832000;4.中国科学院天津工业生物技术研究所,天津 300308)
1 引言
根据我国农业大数据发展现状,农业大数据未来发展需要特别关注的是平台与数据、需求与应用、交易与共享[1]。在农业科技活动中,长期积累和整编的海量科学数据,具有重要的保存和开发利用价值,随着微生物组学数据的日益剧增,微生物大数据的高效管理与分析越来越受到研究者的关注[2]大量的数据本身是没有价值的,需要新的方法和方法来处理、构造、分析、可视化并将数据集成到模型中,通过生物大数据平台推动生物大数据产业发展[3]。目前,农业生物多样性大数据平台框架建设取得了一定的成绩[4],土壤科学中的大数据往往是高度异构的[5],土壤微生物群落的主要驱动因素非生物土壤参数包括精确的GPS地理坐标和气候条件、土壤类型、土壤质地、土壤pH 值等稳定的土壤物理化学性质,农业有关的研究,还包括施肥制度、耕作、植物保护措施、和植物生物量等属性[6]。国际上跨国公司,欧盟和美国都纷纷启动了作物微生物组的重大项目,并已经进入到了功能性研究的阶段,如孟山都及诺维信对解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)和绿木霉菌(Trichoder‐ma virens)开展科学配比与成分优化研究,成功研制种子包衣剂,能够改善作物在苗期的营养元素供给[7]。……
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