白来航鸡干扰素刺激基因12 PCR 扩增
2021-05-21张淑萍葛中东张凯夏宇欣姜莉莉樊兆斌
张淑萍 葛中东 张凯 夏宇欣 姜莉莉 樊兆斌*
(1,菏泽市食品药品检验检测研究院 274000;2,菏泽学院药学院 274715)
干扰素刺激基因(Interferon-stimulated genes,ISGs)是干扰素(IFN)下游的效应分子,IFN 作用于靶细胞表面受体后,通过一系列信号传导激活ISGs 的转录、表达[1,2],在宿主免疫调节及抗病毒过程中发挥重要功能[3]。IFN 通过ISGs 发挥包括抗病毒、凋亡、抗增殖、抗肿瘤和免疫调节在内的多种细胞和生理功能[4]。不同的ISGs 可以针对病毒从入侵到释放的不同阶段发挥抑制作用[5]。以往针对ISGs 的研究主要集中在ISG15、Mx1、PKR 等[6-11],对ISG12 的研究相对较少。ISG12 蛋白作为一个潜在的重要细胞因子,参与了机体的抗病毒过程。人巨细胞病毒(HCMV)、急性丙型肝炎病毒(HCV)感染后,ISG12表达水平均明显提高[12],禽流感病毒(AIV)感染能引起鸡、鸭和小鼠体内的ISG12 mRNA 水平明显升高[13,14]。本研究通过RT-PCR 方法克隆了白来航鸡ISG12 基因,并对其编码蛋白进行生物信息学预测分析,研究结果为深入研究ISG12 编码蛋白功能及其抗病毒的分子机制提供有价值的参考资料。
1 材料与方法
1.1 主要试剂
动物组织总RNA 提取试剂盒、Fast Quant cDNA 第一链合成试剂盒、2×Taq PCR Mastermix、D2000 Marker、凝胶回收试剂盒、DH5α 感受态、pGM-T 载体,质粒小提试剂盒等均购自天根生化科技有限公司;LB 培养基购自Solarbio 公司。
1.2 试验样品
白来航鸡的肝脏、脾脏组织。
1.3 引物设计
根据GenBank 已发表的原鸡ISG12 基因序列(登录号BN000223.1),利用primer premier 5.0 软件设计白来航鸡ISG12基因扩增引物ISG12-F/ISG12-R:ISG12-F:5'-ATGTCTGACCAG
AACGTCC-3',ISG12-R:5'-GGACCGATGCTTCTTTCTA-3',引物由华大基因有限公司合成。
1.4 ISG12 基因PCR 扩增
提取白来航鸡总RNA 并反转录为cDNA,以其为模板,用引物ISG12-F/ISG12-R 进行目的基因扩增。PCR 反应体系:cDNA 1μl,上游引物2μl,下游引物2μl,2×Taq PCR Master Mix 25μl,ddH2O 20μl,共50μl。……
