APP下载

甘薯基因组BBX转录因子基因鉴定与逆境胁迫表达分析

2021-05-13毕楚韵黄小芳黄伟群刘江洪胡韵卓黄碧芳林世强陈选阳

四川农业大学学报 2021年2期

毕楚韵 ,黄小芳 ,黄伟群 ,刘江洪 ,胡韵卓 ,黄碧芳 ,林世强 ,*,陈选阳 ,5*

(1.福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室,福州 350002;2.福建农林大学农学院,福州 350002;3.福建省种子总站,福州 350003;4.福建农林大学生命科学学院,福州 350002;5.福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室,福州 350002)

植物转录因子在植物的生长发育和响应环境变化等生理生化过程中发挥重要作用,通常根据其蛋白结构的特征分为各个家族。Plant TFDB数据库(plant transcription factor database,Plant TFDB)[1]目前已收录包括ZFP、WRKY、MYB、TCP等60多种植物转录因子家族。锌指蛋白(zinc-finger protein,ZFP)是植物中一类数量较多的转录因子家族[2],其主要特征是含有手指状的结构域,且能与锌离子结合。植物锌指蛋白通常含有1~4 个锌指结构[3]。BBX(B-Box)是锌指结构蛋白家族的一个亚家族[4],含有1~2个B-box保守结构域,根据氨基酸序列的特征分为B-box 1(B1)和 B-box 2(B2)。除了 B-box 结构域,一些 BBX 蛋白还拥有 CCT(CO,CO-like,TOC1)结构域。CCT结构域最早被发现于CO(CONSTANS)蛋白的C端,具有核定位功能[5]。随后在CONSTANS类基因和TOC1基因编码的蛋白中也存在且保守,故以该3个基因的首字母命名CCT结构域[6]。BBX转录因子根据序列所含结构域的情况,分为5种类型:Ⅰ/Ⅱ类型(B1+B2+CCT)、Ⅲ类型(B1+CCT)、Ⅳ类型(B1+B2)和Ⅴ类型(B1)[7]。

近年来BBX转录因子在植物中的功能研究越来越多,包括BBX家族在生物或非生物胁迫、光形态建成、植物成花和避荫响应等过程中的作用。Liu H.等的研究显示[8],植株超表达水稻OsCOL9基因后对稻瘟病的抗性增强,敲除基因后则对稻瘟病易感。拟南芥AtBBX18受热胁迫诱导表达,超表达情况下使植株的耐热性下降,对耐热呈负调控作用[9]。……

登录APP查看全文