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基于GEO 数据库的脓毒症标志物的筛选与生物信息学分析

2021-04-29童译庆高婧段光臣周伟秦海军

世界最新医学信息文摘 2021年22期
关键词:差异分析

童译庆,高婧,段光臣,周伟,秦海军

(上海交通大学附属第六人民医院 急诊医学科,上海 200233)

0 引言

脓毒症是机体对于感染反应失调导致的器官功能失调的综合征[1],是急诊ICU常见的急危重症,临床上有极高的发病率和病死率[2],世界卫生组织每年有3000万脓毒症,1940万严重脓毒症每年有600万病例死于脓毒症[3]。病原体入侵引起免疫失衡最终导致的持续过度的炎症反应和晚期剧烈持久免疫抑制是它的主要病理特征,免疫介导损伤被仍为是导致器官损伤的重要原因[4-5]。促炎反应包括有补体系统,凝血反应,血管内皮细胞,白细胞以及血小板的激活,免疫抑制主要是抗原提呈的重新编排以及淋巴细胞的耗竭[6-7]。尽管目前对于脓毒症发病机制较前已经大大增加,但仍需转化为新的靶向治疗。因此通过系统生物学方法深入了解脓毒症的免疫发病机制对于脓毒症的诊断和治疗都有极其重要的作用。近年来随着基因检测技术和生物信息学的发展,这一领域的突破将为脓毒症的早期诊断、预后分析和基因治疗提供新的思路。目前已经有对脓毒症基因表达谱进行的大量的研究,筛选出数千个可能与脓毒症相关的差异表达基因(DEGs),但是各个样本的异质性不同,不同技术检测的平台,不同数据处理的方法以及样本来自不同的背景等,均可能导致不同研究间存在差异,即使在单一的队列研究中仍然存在局限性。因此,我们需要用一种不偏倚的统计方法处理数据,通过合并分析基因表达谱可以解决部分问题。……

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