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基于网络药理学探讨参地补肾胶囊抗肾间质纤维化的机制研究

2021-04-28吴宸广杨菲菲李淑菊

中国中医药科技 2021年3期
关键词:数据库信号

田 锋,吴宸广,陈 明,杨菲菲,李淑菊

(1黑龙江省中医药科学院·黑龙江 哈尔滨 150036;2黑龙江省老年病医院·黑龙江 哈尔滨 150036)

慢性肾衰竭(CRF)特征在于进行性的肾间质纤维化(RIF),最终导致终末期肾脏疾病,其发病率逐渐上升且呈现年轻化的趋势,严重威胁人们的健康,给国家造成严重的经济负担[1]。参地补肾胶囊是国医大师张琪教授根据多年治疗CRF的经验,铆定CRF脾肾两虚、湿浊内蕴的病机特点而拟定,临床上应用于治疗CRF,能够改善患者肾功能,调节脂代谢,提高肾小球滤过率,具有一定的抗RIF的作用[2]。

网络药理学是基于“药物-靶点-疾病”相互作用网络进行药物研究,适合于研究中药与疾病的复杂作用机制。故本文运用网络药理学方法对参地补肾胶囊活性成分及其抗RIF相关靶点进行体统研究,为参地补肾胶囊治疗CRF的临床应用供理论依据。

1 材料与方法

1.1 材料 TCMSP数据库(http://tcmspw.com/tcmsp.php)、Universal Protein数据库(https://www.uniprot.org/)、Gene Cards数据库(https://www.genecards.org/)、OMIN生物数据库(https://www.omim.org/)、Venny2.1在线软件作图工具平台(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/)、STRING数据库(https://string-db.org/)、Metascape数据库(https://www.metascape.org/)和 Cytoscape3.7.2软件、Origin Lab 2019绘图软件。

1.2 方法

1.2.1 药物化学成分及其作用靶点的收集 将参地补肾胶囊中涉及的中药成分(人参、白术、茯苓、大黄、黄连、半夏、草果仁、竹茹、熟地黄、菟丝子、淫羊藿、桃仁、红花、丹参、赤芍)逐一输进中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中进行检索,设定口服生物利用度(OB)≥30%及类药性(DL)≥0.18筛选得到所有中药的活性成分,并在TCMSP数据库检索活性成分对应的作用靶点。所获得的作用靶点名称(protein name)输入到Universal Protein数据库中进行检索,选定物种来源为“human”,找到各靶点对应的基因名(gene name),方便后续的分析。……

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