刘丁丁，王君雅，汤榕津，陈亮，马春雷

茶树基因家族全基因组鉴定及白化相关基因表达分析

刘丁丁1,2，王君雅1,2，汤榕津1,2，陈亮1*，马春雷1*

1. 中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心/农业部茶树生物学与资源利用重点实验室，浙江 杭州 310008； 2. 中国农业科学院研究生院，北京 100081

三角状五肽（PPR）蛋白作为一类靶向定位于半自主细胞器的序列特异性RNA结合蛋白，在植物的生长发育过程中具有重要的作用。本研究基于茶树基因组数据，利用生物信息学方法对茶树基因家族进行系统鉴定，并对其蛋白质理化性质、结构域保守性、亚细胞定位、基因结构、染色体定位与分布等进行了分析。结果表明，在茶树基因组数据中共鉴定到858个基因，分属于P和PLS两个亚家族；结构域分析表明各个结构域在茶树中比较保守；亚细胞定位结果显示超过一半的CsPPR蛋白定位于叶绿体；基因结构分析表明茶树基因家族中共有31%的基因不具有内含子结构，并且家族成员在进化过程中发生过多次基因复制事件。另外，为探究茶树基因家族在调控茶树白化相关基因表达过程中的作用，对正常叶色品种舒茶早和安吉黄茶等5个白化茶树品种进行转录组测序，共筛选到24个差异共表达基因，并利用实时荧光定量PCR技术对其在不同品种和不同组织中的表达模式进行了分析，结果显示大多数基因在新梢、成熟叶和茎中高表达，但在花和根中痕量表达。本研究结果可为茶树家族成员的基因克隆和功能研究提供参考。……