中国水产科学研究院长江水产研究所李忠研究员团队开展黄鳝基因组染色体图谱研究，获得了首个高质量基因组参考图谱，研究结果近日在《G3:Genes/Genomes/Genetics》杂志在线发表。这是该团队在国内首次完成黄鳝全人工规模化繁育基础上取得的又一重要成果，为加速黄鳝新品种选育奠定了重要基础。

该研究采用Illumina二代测序、PacBio SeqII三代测序及Hi-C技术，结合先进组装策略获得了完整连续的高质量黄鳝全基因组。基因组大小为799 Mb(Contig N50=2.4 Mb, Scaffold N50=67.24 Mb)，组装得到12条染色体序列，覆盖预测基因组大小的99.26%；鉴定出364 802个微卫星(SSR)位点，得到287 189个候选SSR标记，利用鉴定出的SSR标记构建了高密度物理图谱，并对部分分子标记进行了验证，分子标记的开发和利用将极大加速辅助育种过程。通过对基因组进行分析发现，黄鳝与大刺鳅在499万年前分化，随后黄鳝有769个基因家族发生了扩增，功能注释显示集中在免疫系统相关途径、感觉系统如嗅觉传导、信号传递等系统。这些发现为研究黄鳝核型进化、表皮呼吸及其独特性逆转特性等研究提供了重要数据。

黄鳝是重要的淡水养殖品种，2019年全国产量31.9万t，基础产值超过200亿元，是全面推进乡村振兴战略的重要抓手。同时黄鳝又是独特的雌雄同体、雌性先熟的性逆转鱼类，具有极高的性别研究价值。同鳗鲡产业一样，黄鳝产业一直靠捕捞野生苗种进行再养殖，产业始终受困于资源量而无法扩大；人工繁殖瓶颈的制约，也限制了基础科学研究的推进。近年来，李忠研究员团队开展了黄鳝全人工规模化繁育研究，于2019年通过长江所和仙桃市人民政府组织的11家教学/科研单位专家团队的现场验收。……