APP下载

云南杂交玉米SSR标记核心引物的筛选及多样性分析

2021-04-15姚宗泽杨肖艳张艳明赵自仙

核农学报 2021年4期
关键词:检测

姚宗泽 杨肖艳 张艳明 段 忠 赵自仙

(1云南农业大学农学与生物技术学院,云南 昆明 650201;2大理白族自治州农业科学推广研究院,云南 大理 671005;3云南省绿色食品发展中心,云南 昆明 650224)

简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)也称为微卫星标记,由2~5 个核苷酸为重复单位串联组成,广泛分布在整个真核生物基因组中。同一种植物中,在各个位点上重复单位的数量也不完全相同,从而形成了多态性,即SSR 分子标记[1]。大量研究表明,除在个别作物中SSR 位点等位基因数目不多外,很多作物中均表现出较高的多态性,一个SSR 位点等位基因数目最多可达几十个[2-3]。不同作物品种的遗传组成不同,使得基因组DNA 中SSR 的重复次数也存在差异,这种差异可先通过PCR 扩增,再借助琼脂糖凝胶电泳或聚丙稀酸胺凝胶电泳等技术检测到SSR[4]。

根据重复单位碱基数可将SSR 分为1~6 核苷酸重复类型[5],所有类型的微卫星中,单核苷酸重复和二核苷酸重复的微卫星在基因组中出现的频率最高。同一重复类型中,不同的碱基重复多态性也不一致。大豆中大于15 个重复单位的(GA)n的多态性较低,而较多的(AT)n重复的SSR 具有较高的多态性信息量[6]。Weber[7]按照微卫星核心序列结构的不同将微卫星标记分为三种类型:完全型(perfect)、不完全型(imperfect)和复合型(compound)。与其他分子标记技术相比,SSR 技术具有多态性高、呈共显性、对DNA 数量及质量要求不高、操作简单、成本低等优点[4]。

相关研究报道比较了DNA 指纹技术在植物新品种判定中的可行性,表明DNA 指纹技术的鉴定结果客观可靠[8-12]。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

检测
QC 检测
小波变换在PCB缺陷检测中的应用