2021年3月8日，《中文核心期刊要目总览》2020年版(第9版)编委会发来通知函，《长江科学院院报》被收录为北大中文核心期刊(水利工程类)，这是《长江科学院院报》自1992年首次入编以来，连续第九次入编。

“北大中文核心期刊”每3～4年评选一次，收录了我国各学科领域中较重要的、能反映本学科发展水平的科技期刊，其评价结果科学合理，符合客观实际，是国内权威的统计源期刊目录。

除北大中文核心期刊外，《长江科学院院报》还被中国科技核心期刊、中国科学引文数据库(CSCD)核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊等多家核心期刊统计源数据库连续收录，在“水利工程”类核心期刊中排名稳步提升，并先后获得 “全国水利系统优秀期刊”“湖北省精品期刊”“湖北省最具影响力学术期刊”等荣誉，并入选国家一流科技期刊重点培育目录。