王兴强, 郑年昊, 崔春辉, 曹 梅, 沈 晔, 刘 莹, 张子文, 汤子威, 秦传新, 陈百尧

金乌贼热休克蛋白基因的挖掘及对低盐胁迫的响应

王兴强1, 郑年昊1, 崔春辉1, 曹 梅1, 沈 晔1, 刘 莹1, 张子文1, 汤子威1, 秦传新2, 陈百尧3

(1. 江苏海洋大学 海洋科学与水产学院, 江苏 连云港 222005; 2. 中国水产科学研究院 南海水产研究所, 广东 广州 510300; 3. 连云港市农业农村局, 江苏 连云港 222005)

热休克蛋白(heat shock proteins: HSPs)为动植物响应外界胁迫产生的一类蛋白质, 能有效改善机体对外界胁迫的适应能力。本研究基于先前获得的低盐胁迫金乌贼()高通量转录组数据, 对与低盐胁迫密切相关的热休克蛋白(热休克蛋白家族和晶体蛋白(crystallin)家族)基因进行挖掘; 鉴于实时定量内参基因筛选, 同时挖掘出金乌贼肌动蛋白(actin)家族系列基因; 然后, 对肌动蛋白、热休克蛋白和晶体蛋白家族基因及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析并探究低盐胁迫对金乌贼热休克蛋白和晶体蛋白家族基因表达的影响。金乌贼肌动蛋白家族基因包括、内收肌、胞质、、和6个成员, 热休克蛋白家族基因包括、小、、、、、、、、和11个成员, 金乌贼晶体蛋白家族基因包括、、和4个成员。氨基酸序列比对发现, 肌动蛋白家族6个基因共享甘氨酸、精氨酸、丝氨酸、异亮氨酸、苏氨酸和天冬氨酸等13个位点, 晶体蛋白家族4个基因共享苯丙氨酸、天冬酰胺、甘氨酸、天冬氨酸、脯氨酸、精氨酸、酪氨酸、丝氨酸和半胱氨酸等17个位点, 而热休克蛋白家族、小、、和5个基因共享1个甘氨酸位点和4个保守位点,、、、、和6个基因仅共享2个保守位点。……