唐加龙，周 莉，孙祖越，张立超

(1.上海中医药大学附属市中医医院药剂科，上海 200071；2.复旦大学药学院，上海 200031)

自身免疫性疾病(autoimmune diseases，AIDs)是一类难治性疾病，具有多种危害，严重影响了患者生活质量，其中类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)、银屑病、系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)是临床主要疾病。寻找特异生物标志物有利于疾病诊断和防治[1]。中药天然药物苷类、生物碱类成分用于AIDs的治疗，新型炎症免疫反应软调节药物芍药苷-6-氧-苯磺酸酯也是来源于中药活性成分芍药苷的结构修饰产物，中药防治不良反应少，疗效确切[2]。

蛋白-蛋白互作 (protein-protein interaction，PPI)网络对调节细胞行为至关重要，联动的细胞信号网络相互作用可引发复杂疾病，基于PPI网络的构建分析鉴定具有疾病特异性的蛋白、基因等是生物标志物研究的新方法[3]。网络药理学通过PPI网络探索基因和miRNA等在疾病中的整体作用机制，从大数据中鉴定有价值的生物学靶标作为疾病生物标志物和药物靶点[4]。有研究[5-6]分别基于网络药理学和代谢组学、转录组学的整合策略发现了PPI网络预测筛选得到的枢纽基因与中药疗效标志存在潜在关联。AIDs发生机制诸如表观遗传调控作用复杂多样，表观遗传基因miRNA就可调节多个靶基因形成复杂分子调控网络参与疾病，中医药治疗与AIDs发病均是多途径、多靶点、多机制作用的综合效应，传统药理学方法研究较为困难[4,7]。

新兴的网络药理学研究方法在阐明疾病复杂病理机制和中药多成分、多靶点、多途径作用特点中得到广泛应用。……