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本期“生物信息”专栏评述

2021-03-26本期生物信息专栏主持人沈百荣

电子科技大学学报 2021年6期
关键词:生物分析

本期『生物信息』专栏主持人 沈百荣

评“嗜乳脂蛋白基因在肺腺癌中的功能及预后作用:多组学融合与生存分析”沈百荣

近年来,随着各种组学测定技术的飞速发展,多组学数据融合结合临床表型分析、用于鉴定癌症致病基因和治疗靶点已成为一个研究热点,它不仅加深对癌症发生发展分子机制的理解,还有助于生物标志物的发现、为癌症的诊疗提供理论依据。

嗜乳脂蛋白(butyrophilins, BTNs)基因家族在免疫调节过程中发挥着关键的作用,是癌症免疫治疗的潜在靶点,但其作为肺腺癌预后生物标志物的潜能尚不明确。该文采用多组学融合与生存分析的方法,通过分析BTNs 在肺腺癌肿瘤和正常对照组织中的表达水平及其与肺癌进展的相关性,鉴定出与肺腺癌进展密切相关的BTN 基因家族成员BTN2A2 和BTNL9,并从基因表达与肺腺癌患者总体生存期的相关性、基因表达与免疫细胞浸润的相关性、相互作用蛋白和共表达基因显著富集的生物过程等多个方面,揭示了BTN2A2 和BTNL9 在肺腺癌中的功能及预后作用。

该文为研究BTNs 在肺腺癌中的功能提供了潜在的临床转化的证据和线索,但这还只是开始,在细胞的生命过程中,生物分子往往不是单独发挥作用的,我们需要从系统生物学的角度出发,不仅需要通过大量的体内和体外实验对BTNs 功能进行解析和验证,还要从基因表达调控和相互作用网络的角度出发,揭示BTNs 在肺腺癌中的作用,进而更好的个性化地指导临床决策。……

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