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新西兰兔RBM4基因的克隆、序列分析及组织表达

2021-03-22魏后军胡波陈萌萌范志宇宋艳华仇汝龙朱伟峰王芳

江苏农业科学 2021年2期
关键词:表达

魏后军 胡波 陈萌萌 范志宇 宋艳华 仇汝龙 朱伟峰 王芳

摘要:为分析RBM4基因在新西兰兔不同组织的表达差异情况,本研究根据GenBank中公布的穴兔RBM4基因序列设计了特异性引物,从兔肾脏中扩增出RBM4基因并进行了生物信息学分析,同时采用实时荧光定量PCR技术研究了RBM4基因在新西兰兔各组织中的表达差异。结果表明,扩增出的新西兰兔RBM4基因长度为1 080 bp,编码359个氨基酸。序列比对结果显示,新西兰兔与穴兔、牛、鼠、人、鲑鱼等动物RBM4基因的核苷酸一致性为44.1%~99.8%。进化树分析结果表明,新西兰兔RBM4基因与其他哺乳动物RBM4基因亲缘关系较近。实时荧光定量PCR结果显示,RBM4基因在新西兰兔的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和脑中均有表达,其中在肾脏中表达量最高,在脑中表达量最低。本研究成功克隆了新西兰兔RBM4基因,并研究了其mRNA在兔各组织中的表达情况,为研究兔RBM4基因的表达及其生物学功能奠定了基础。

关键词:RBM4基因;克隆;序列分析;表达;新西兰兔

中图分类号: S852.2文献标志码: A文章编号:1002-1302(2021)02-0033-04

收稿日期:2020-11-09

基金项目:现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-43-C-1)。

作者简介:魏后军(1986—),男,江苏南京人,硕士,助理研究员,主要从事家兔疾病防治与兽医生物技术研究。E-mail:whj280941235@126.com。

通信作者:王芳,博士,研究员,主要从事家兔重要疫病致病机制及防控技术研究。E-mail:rwangfang@126.com。

RNA结合基序蛋白4(RNA binding motif protein4,RBM4)是一种多功能RNA结合蛋白,参与多种转录后调控过程,包括前体mRNA(pre-mRNA)的选择性剪接、翻译控制等[1]。人RBM4含有364个氨基酸,分子大小约40 ku,N端含有2个RNA识别基序(RNA recognition motifs,RRMs)和1个CCHC型锌指结构,RRMs是结合RNA的主要位点;C端有3个富含丙氨酸的延伸,具有RBM4的细胞定位及与其他蛋白质互作的作用[2]。……

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