基于生物信息学分析F2R基因在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义
2021-03-18陈梁玥段怡平柳家翠马甜甜朱翠雯邹晓沨
陈梁玥 段怡平 柳家翠 马甜甜 朱翠雯 邹晓沨
据报道,2018年在世界范围内,胃癌(gastric cancer,GC)有1 033 701例新增病例,造成783 000人死亡[1],因其死亡人数占癌症相关死亡总人数的8.2%,这使GC 成为继肺癌和结直肠癌(死亡率18.4%和9.3%)后第三大与癌症相关的死亡原因[2]。由于缺乏早期诊断标志物,大多数胃癌患者诊断时已处于晚期阶段,其五年生存率仅为30%[3]。因此,深入认识胃癌的分子发病机制,寻求对GC 更敏感的生物标志物,对改善胃癌患者的总体生存期至关重要。凝血因子II 凝血酶受体(coagulation factor II receptor,F2R)又称蛋白酶激活受体1(protease activated receptor 1,PAR1)属于G 蛋白偶联受体家族,该家族有四种亚型,其中PAR1是研究最深入的一种[4]。目前研究认为,F2R可能是作为某些介导恶性肿瘤转移物质的受体而起作用,包括凝血酶、基质蛋白酶、血管内皮生长因子和整合素家族[5-6]。另外,F2R可以通过参与细胞信号传导[7],激活炎症反应,破坏内皮屏障和参与免疫逃逸等机制参与肿瘤进程[8]。近年来,有研究表明,F2R在多种恶性肿瘤中高表达,且这种表达与肿瘤侵袭、转移等生物学行为密切相关,并提示预后不良[9]。然而,F2R在胃癌的发生发展中扮演的角色和分子机制尚未阐明。本研究通过分析TCGA 数据库获得的微阵列数据,探索F2R在胃癌中的表达、免疫浸润及预后价值,并预测F2R在胃癌发生发展中的分子作用机制。
1 材料与方法
1.1 数据采集
从TCGA 数据库下载有关基因表达,免疫系统浸润和相关临床信息数据,其中包括375 个肿瘤组织和32 个正常组织。对基因表达数据进行归一化处理,并Log2 转化后用于后续分析。……
