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荆州地区HPV-52型E7基因多态性分析和T细胞表位预测

2021-03-18李烁叶梦霞梅冰

分子诊断与治疗杂志 2021年2期

李烁 叶梦霞 梅冰

在中国宫颈癌的发病率居女性恶性肿瘤的第二位,与人乳头瘤状病毒(Human papillomavirus,HPV)持续感染密切相关[1]。HPV 是小的双链DNA 病毒,目前已发现200 多种HPV 亚型,其中十二种高危亚型(16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58 和59)具有致癌性[2]。E7 蛋白可以结合并抑制成视网膜细胞瘤蛋白pRb,释放E2F 促进细胞增殖,在HPV 诱导的癌变中起关键作用[3]。因此,E7 蛋白是开展疫苗免疫治疗研究的理想靶点[4]。HPV-16 和HPV-18 是全球最常见的两种高危型HPV[5]。然而HPV 亚型分布有地域差异,已有研究表明湖北荆州地区HPV-52 亚型检出率最高[6]。高危型HPVE7基因突变导致氨基酸变异,可能影响宿主免疫应答和疫苗治疗效果[7]。目前国内外研究集中在HPV-16 和HPV-18 亚型,而对HPV-52 亚型的研究相对较少[8-9]。疫苗研究设计时应重点关注本地区检出率较高的HPV 亚型,因此本研究通过分析湖北荆州地区HPV-52E7基因多态性、变异株谱系分布、阳性选择位点和T 细胞表位预测,以期为本地区该病毒发展诊断和治疗性疫苗的研究提供重要数据。

1 资料和方法

1.1 一般资料

收集2019年9月至2020年7月在本院进行高危型HPV 分型检测的女性宫颈脱落细胞样本3 910例。平均年龄(42.1±10.3)岁。宫颈脱落细胞样本由妇科医生使用专用样本采集器采集,将其置于加有专用细胞保存液的取样管中。样本采集后放置于4℃保存,24 h 内完成样本检测。样本采集前获得患者知情同意并签署知情同意书,本研究获得医院伦理委员会批准。

1.2 方法

1.2.1 HPV DNA 提取和分型

HPV 分型试剂采用上海之江生物科技股份有限公司HPV 分型试剂盒(荧光PCR 法),按照试剂盒说明书进行DNA 提取和分型检测。……

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