地黄RgMATE6转运蛋白基因的克隆、亚细胞定位与表达分析
2021-03-17杨艳会张重义伊艳杰李瑞芳张宗武王超杰
杨艳会,杨 恒,张重义,伊艳杰,李瑞芳,董 臣,张宗武,王超杰
地黄转运蛋白基因的克隆、亚细胞定位与表达分析
杨艳会1,杨 恒1,张重义2,伊艳杰1,李瑞芳1,董 臣1,张宗武1,王超杰1
1. 河南工业大学生物工程学院,河南 郑州 450001 2. 福建农林大学作物科学学院,福建 福州 350002
克隆地黄多药及有毒化合物外排(multidrug and toxic compound extrusion,MATE)转运蛋白基因,并进行亚细胞定位与时空表达分析,为深入研究其在地黄转运次生代谢产物中的分子功能奠定基础。利用地黄转录组数据库候选基因序列,利用实时荧光PCR(RT-PCR)克隆基因;利用生物信息学软件对其编码蛋白的结构、理化性质、同源性和进化树进行分析;通过与绿色荧光蛋白(GFP)融合表达进行亚细胞定位;利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)的方法测定该基因的时空表达模式。克隆获得1892 bp的基因序列,基因编码524个氨基酸、具有2个典型的MatE结构域和12个跨膜结构;RgMATE6蛋白与越橘的VcMATE6蛋白亲缘关系最近;RgMATE6-GFP载体瞬时表达的结果发现RgMATE6蛋白定位在液泡膜上;qRT-PCR分析发现基因在地黄不同时期的根中表达最高,尤其是块根膨大前期。RgMATE6蛋白定位在液泡膜上,在地黄块根膨大期的根中表达较高,初步表明RgMATE6可能参与地黄体内次生代谢产物向液泡转运的过程。
地黄;MATE转运蛋白;生物信息学;亚细胞定位;表达分析
地黄Libosch为玄参科地黄属多年生草本植物,是我国传统的四大怀药之一。地黄体内的许多次生代谢产物均具有生物活性,常见的有毛蕊花糖苷、梓醇及多糖类,具有抗炎、抗肿瘤、缓泻等作用,在临床上广泛应用[1]。……
