烟草暴露对孕妇胎盘组织基因表达谱影响的机制研究
2021-03-17候燕,孙媛
候 燕,孙 媛
孕妇烟草暴露已被证实是多种不良妊娠结局的危险因素[1]。研究资料显示,孕妇在孕前与孕期长时间与烟雾接触会增加流产、早产、死胎等发生风险。除此之外孕妇在孕前、孕期主动或被动吸烟,出现胎儿畸形、生长受限及低出生体重、神经精神系统、呼吸系统等疾病的概率大大增加[2-3]。有研究报道,孕妇在妊娠早期吸烟可能造成绒毛缺氧,同时可能影响血管生成和细胞凋亡[4]。烟草烟雾中含有的多种致癌物质和细胞毒性化学物质共同介导慢性炎症及破坏性重塑事件等机体反应。现阶段,烟草烟雾对成人的生理和病理的分子机制研究虽然相对较多,但具体机制仍不清晰。相比之下,人们对烟草暴露对孕妇及胚胎发育影响的机制更是知之甚少。本研究通过生物信息学方法分析妊娠期间吸烟和不吸烟妇女胎盘组织的转录谱,探究孕期烟草暴露对孕妇机体作用的机制。
1资料与方法
1.1 一般资料:本研究从公共基因芯片数据平台GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库中搜索到基因芯片数据集GSE71931,芯片共包含4例样本,其中包含孕期吸烟2个孕妇样本及对照组2个样本,其芯片平台是GPL13158 [HT_HG-U133_Plus_PM] Affymetrix HT HG-U133+ PM Array Plate。
1.2 差异基因(DEGs)的筛选:通过GEO2R分析,设定筛选条件P<0.05,logFC绝对值>1.0,将得到的差异基因去重,并删除无对应名称的基因片段,筛选差异表达基因。
1.3 DEGs的GO和KEGG分析:本研究通过DAVID(The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery v6.8,https://david.ncifcrf.gov/)数据库在线分析提供所需的GO生物功能富集数据和KEGG通路分析,以发现差异表达的基因可能参与的生物学通路[6-7]。使用Fisher Exact 或EASE Score 统计方法,GO各……
