生长异质大西洋鲑转录组学分析
2021-03-11聂苗苗王振吉祁得林
章 昭,聂苗苗,高 强,刘 丹,王振吉,祁得林*
(1.省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学,青海 西宁 810016;2.青海大学农牧学院,青海 西宁 810016;3.青海省渔业环境监测站(青海省高原水生生物及生态环境重点实验室),青海 西宁 810012)
大西洋鲑(Salmosalar), 俗称三文鱼,主要分布于大西洋北部及其附近河流流域,隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)、辐鳍鱼亚纲(Actinopterygii)、鲑形目(Salmoniformes)、鲑科(Salmonidae),因其营养丰富,经济价值高,成为人们最喜爱的高档水产品。根据FAO统计数据显示,2017年至2018年全球养殖大西洋鲑总产量达244.5万t,预计2020年达到260万t[1]。但由于大西洋鲑在中国没有自然分布,且对生长环境要求较高,人工育苗和养殖难度较大,所以我国利用工厂化养殖大西洋鲑的技术尚处于起步阶段。2016年4月,青海省首次从冰岛引进淡水大西洋鲑发眼卵24 000粒进行孵化,经过2年的工厂化循环水养殖实验发现,同一批次大西洋鲑最大个体体重达到4.6 kg,而最小个体体重不足0.5 kg,养殖群体表现出显著地生长异质性。目前,对鱼类个体生长异质相关的研究多集中于遗传因素[2]、养殖密度[3]、社会等级因素[4]等方面。但对相同饲养管理条件下,产生生长异质的分子机制尚不明确。
基于此,文中以大西洋鲑为研究对象,利用转录组测序技术获得生长异质大西洋鲑的基因表达差异情况,并对差异基因进行GO功能富集、KEGG通路富集分析,期望能从转录组学研究中解析大西洋鲑生长异质的原因,从而为大西洋鲑的遗传繁育提供参考依据。
1 材料和方法
1.1 试验材料
本研究以同一养殖环境下的24月龄雄性大西洋鲑作为研究对象,随机选择生长速度较慢,平均体重为0.51 kg的3尾鱼,作为慢速生长组;……
