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万安玻璃红鲤鱼PKR的克隆鉴定与系统进化分析[4]

2021-03-01朱圆玉胡有生

罗 辉,陈 洁,邵 敏,曾 菲,万 力,朱圆玉,胡有生,3

万安玻璃红鲤鱼PKR的克隆鉴定与系统进化分析[4]

罗 辉1,陈 洁1,邵 敏1,曾 菲2,万 力1,朱圆玉1,*胡有生1,3

(1. 井冈山大学医学部,江西,吉安 343009;2.吉安县疾病预防控制中心,江西,吉安县 343100;3.南昌大学抚州医学院,江西,抚州 344000)

本研究以万安玻璃红鲤鱼为材料,通过同源克隆的方法克隆了万安玻璃红鲤鱼双链RNA激活的蛋白激酶(PKRCcvwPKR),并首次克隆到CcvwPKR的剪接异构体。CcvwPKR全长为2145 bp,编码714个氨基酸,CcvwPKR剪接异构体全长1431 bp,编码476个氨基酸。CcvwPKR的剪接异构体是CcvwPKR第477个密码子的G突变为T(gaa477taa),从而使得CcvwPKR的翻译提前终止。氨基酸序列比对和空间结构SMART预测显示,CcvwPKR和CcvwPKR剪接异构体都含有三个双链RNA结合模体(dsRBM),CcvwPKR剪接异构体缺失PKR的C端的激酶结构域。系统进化分析表明,万安玻璃红鲤鱼PKR在进化上与鲤鱼和鲫鱼密切相关。万安玻璃红鲤鱼和目前已有研究的鲤科鱼类PKR一样,分子结构都含有三个dsRBM,三个dsRBM使得其具有更强的结合dsRNA的作用,推测可能与其较强的抗病能力有关。

万安玻璃红鲤鱼;双链RNA依赖的蛋白激酶; 基因克隆;基因鉴定

双链RNA(dsRNA)依赖的蛋白激酶(PKR),是细胞中重要的dsRNA传感器,能够识别并结合病毒dsRNA,引起抗病毒免疫反应。PKR也可识别并结合细胞在各种刺激作用下产生的内源性的dsRNA,并引起的抗肿瘤免疫反应。PKR结合dsRNA后,发生二聚化活化,活化后的PKR可磷酸化真核细胞初始化因子2α(subunt of eukaryotic intiation factor 2,eIF-2α),从而抑制蛋白翻译的起始,抑制病毒繁殖或引起肿瘤细胞的凋亡[1-2]。

PKR的结构包括N端的dsRNA结合结构域(dsRNA-binding domain,dsRBD),主要介导PKR与dsRNA的结合并引起PKR的二聚化活化,因此其识别和结合dsRNA的能力就直接影响PKR的活化,所以又称为PKR的活性调节结构域;……

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