高通量基因测序在血液肿瘤临床应用的质量管理现状及展望

2021-02-27吴祁生王芳聂代静周晓苏陈佳琦刘红星

分子诊断与治疗杂志 2021年5期

吴祁生王芳聂代静周晓苏陈佳琦，刘红星，，*

血液肿瘤是发生于造血或淋巴组织的具有高度异质性的疾病，其临床诊疗需要结合病理、血细胞形态、免疫表型、细胞遗传、分子生物学和临床表现进综合分析。世界卫生组织（world health or-ganization，WHO）的《造血与淋巴组织肿瘤分类》［1-2］与美国国家综合癌症网络（national compre-hensive cancer network，NCCN）的血液肿瘤临床诊疗指南［3-5］都越来越多纳入了具有临床诊断分型和/或预后意义的基因变异指标，包括基因突变、融合基因及基因异常表达等。这些基因变异在血液肿瘤的诊断分型、预后分层、治疗指导、微小残留病监测和耐药突变监测等方面有重要临床应用价值［1-5］。下一代高通量基因测序（next generation se-quencing，NGS）可一次对多个肿瘤相关基因、全外显子或基因转录本进行检测，具有通量高、灵敏度高、成本低等优势［6-7］。

血液肿瘤临床诊疗对NGS 的应用有着迫切的需求。相对于病理机制研究和治疗手段的巨大进步，血液肿瘤的实验室检测严重滞后，尤其是NGS的应用方面。不同于传统的分子诊断技术，血液肿瘤NGS 技术流程复杂，除核酸提取、PCR 扩增、产物分析等步骤，还有文库构建、文库富集和上机测序过程，更有测序结果的生物信息学分析［8-9］。这套复杂的系统对“人、机、料、法、环”各方面的质量管理和保证提出了更高的要求［10］。本文基于NGS 在血液肿瘤临床应用中的质量管理要素现状提出见解，并做以展望，以期为血液肿瘤NGS 临床应用的规范化起到正向作用。