基于TCGA数据库分析FNDC3B基因在胰腺癌中的表达及预后意义
2021-02-25洪俊强孔祥泉杜开新罗水英林小艺罗惠煌连舒晴廖雪洪
洪俊强,孔祥泉,杜开新,罗水英,林小艺,罗惠煌,连舒晴,廖雪洪
1.福建医科大学附属厦门弘爱医院放疗科,福建厦门 361000;2.福建省龙岩市第一医院放疗科,福建龙岩 364000;3.厦门大学附属中山医院病理科,福建厦门 361000
胰腺癌是一种常见的消化系统肿瘤,恶性程度高,预后差,5年生存率仅为9%,只能通过手术来治愈[1]。早期发病的时候常常没有任何症状[2-3],90%以上的胰腺癌患者就诊时已是中晚期,通常需要各个学科的综合治疗[4]。胰腺癌异质性很高,利用分子分型可以更好地预测肿瘤预后,制定有效的治疗策略,提高患者的生存率[5]。FNDC3B是癌症组织中最常见的上调基因之一,与癌症类型和肿瘤起源无关[6]。研究表明,FNDC3B在乳腺癌、食管癌、胶质母细胞瘤和肝细胞癌中高表达,并与癌细胞增殖、侵袭和转移有关[7-11]。然而,FNDC3B在胰腺癌中的作用研究至今未见报道。因此,该研究将探索FNDC3B在胰腺癌细胞中所起的作用。基于对肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库的深入分析,探讨FNDC3B在胰腺癌中的表达水平与临床病理特征、预后的关系,并寻找调控FNDC3B的信号通路。现报道如下。
1 资料与方法
1.1 一般资料
从TCGA网站下载关于胰腺癌的基因表达数据及信息,并规范化原始测序数据,通过基因作图进行注释,最终一共筛选了141个胰腺癌样本,均含有FNDC3B表达水平和完整的临床信息,根据FNDC3B的表达量中位数将样本分为FNDC3B低表达组(69例)及FNDC3B高表达组(72例)。利用The Human Protein Atlas网站,下载胰腺癌肿瘤组织中FNDC3B免疫组化染色的图片。见图1。

图1 胰腺癌组织中……
