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椰子SPL基因家族的生物信息学及其表达分析

2021-02-05钟雅珠马伯军范海阔陈析丰弓淑芳窦雅静孙熹微

中国南方果树 2021年1期
关键词:水稻

钟雅珠,马伯军,范海阔,陈析丰,弓淑芳,刘 蕊,窦雅静,孙熹微,肖 勇

(1 浙江师范大学,浙江金华,321000;2 海南省热带油料生物学重点实验室/中国热带农业科学院椰子研究所,海南文昌,571339)

Squamosa promoter binding protein like(SPL)基因又称为Squamosa promoter binding protein (SBP)-box proteins,是植物特有的一类转录因子,是植物生长发育过程中重要的调节基因。它们的翻译产物能够特异地与DNA分子结合,并通过激活或抑制下游靶基因的转录对基因表达进行调控。1996年Klein等最早在金鱼草中发现并分离出该基因,即AmSBP1和AmSBP2。因这两个基因能够能识别花发育基因SQUAMOSA的启动子结合位点,被命名为Squamosa promoter binding protein[1]。SPL基因家族蛋白含有1个高度保守的SBP-box结构域,是SPL蛋白和DNA分子特异性结合所必需的。它由大约76个氨基酸组成,一般包括两个锌指结构域(Zinc-finger domain)[2],即Cys-Cys-His-Cys(C2HC)、Cys-Cys-Cys-His(C3H),以及1个位于C末端的保守核定位信号(Nuclear localization signal,NLS)[3]。

SPL基因家族是多基因家族,在植物的生长发育过程中发挥重要的调控作用。目前已在很多物种中被鉴定和报道。拟南芥共鉴定出17个SPL基因,Cardon等在1997年发现AtSPL基因参与开花时间的调控,拟南芥中存在Squamosa基因的同源基因AP1,AtSPL3能识别AP1的启动子序列,AtSPL3过量表达会导致开花提前[4]。水稻共鉴定出19个SPL基因,其主要功能是参与花发育的调控。将近一半的OsSPL基因能够在愈伤组织中表达,表明这些基因可能参与植物的形态构成过程[5]。OsSPL14 和OsSPL16有减少分蘖,提高产量的作用[6-7]。另外,miRNA与SPL基因之间也有联系,miR156过量表达可以影响部分SPL成员的表达水平[8]。白桦中共鉴定出18个SPL基因,BpSPL基因可能是顶芽和雄花序生长发育的调节基因[9]。葡萄中共鉴定出19个SPL基因,VvSPL家族成员参与特定时期果实生长发育与成熟的调控[10]。……

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