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基于转录组的漆树MYB转录因子的筛选及分析

2021-01-26谢冬冬王武萍何学高黄晓华

西北林学院学报 2021年1期

谢冬冬,王武萍,何学高,黄晓华*

(1.西北农林科技大学 林学院,陕西 杨陵 712100;2.中华全国供销合作总社 西安生漆涂料研究所,陕西 西安 710000)

转录因子是真核生物细胞内通过与特定基因启动子结合以调控下游基因的表达的一类蛋白[1]。通常含有寡聚化位点(oligomerization site)、转录激活区(activation domain)、DNA结合区(DNA-binding domain)以及核定位信号区(nuclear localization signal)等功能区域[2]。植物中转录因子类型多样,常见的有WRKY类、ERF类、MYB类等,而MYB类转录因子是植物转录因子中数量较多的家族之一,其功能多样[3]。MYB-DNA结合结构域(MYB-binding domain)是一段含有50~53个氨基酸残基的不完全保守肽段[4]。该结构域中分布有3个起疏水核心作用的相对保守的色氨酸残基(彼此间隔18或19个氨基酸残基),维持MYB转录因子的构型[5]。MYB转录因子通常含有1~4个串联的MYB-DNA 结合结构域,依据MYB转录因子含有的结合结构域数目的差异可将其分为4类,R1-MYB、R2R3-MYB、R1R2R3-MYB和R4-MYB[6]。其中R2R3类转录因子中R3结构域的第一个色氨酸残基通常被亮氨酸、异亮氨酸或苯丙氨酸等所取代[7]。在植物中发现的第一个MYB转录因子是玉米穗基因C1编码的参与花青素代谢合成的C-MYB-like[8]。现发现MYB类转录因子对植物的整个生命过程都具有重要的意义,包括形态建成[9]、生长发育[10]、对生物和非生物胁迫的应答[11-12]以及植物初生和次生代谢等[13]。

漆树(Toxicodendronvernicifluum)为漆树科(Anacardiaceae)漆属(Toxicodendron)落叶乔木或小乔木,属亚热带区系,新生代第三纪古老孑遗树种[14],雌雄同株或异株,变异类型多,历经7 000多万a的演化,弥足珍贵[15]。但由于漆树种植的存活率偏低和过度利用,我国目前保存的漆树资源稀少,下降趋势明显,发展前景堪忧[16]。……

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