m6A结合蛋白IGF2BP1在肝细胞癌中的基因调控网络分析
2021-01-18周子寒周先果陈佩琴林秋伶冯世雄温秋萍龚文峰马良余红平
周子寒 周先果陈佩琴林秋伶 冯世雄 温秋萍 龚文峰 马良 余红平
作者单位:530021 南宁 1广西医科大学附属肿瘤医院;2广西医科大学公共卫生学院
原发性肝癌(简称肝癌)是全球第六大常见恶性肿瘤,其死亡率居全部癌症的第四位[1]。肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是肝癌最常见的病理组织学类型,约占肝癌的90%以上。近年来,虽然HCC诊断和治疗方面取得较大进步,但其复发率和转移率均较高,患者术后5年生存率仍较低[2]。目前肝癌的发病机制尚不完全清楚,给临床上有效防治造成了巨大困难。
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)修饰是真核生物信使RNA(mRNAs)中最普遍、最丰富且最保守的内部修饰[3]。m6A甲基化修饰主要发生在mRNA的终止密码子和3′非翻译区(3′UTR)位置上,可以影响RNA的转录、加工和翻译等过程[4-5]。m6A修饰过程主要由甲基化转移酶(Writers)、去甲基化酶(Erasers)和阅读器(Readers)介导[6]。Writers是将甲基化修饰“写入”RNA,即介导RNA的甲基化修饰过程,最常见的分子是METTL3和METTL14。Erasers能将RNA甲基化修饰信号“擦除”,即介导RNA的去甲基化修饰过程,如脂肪量和肥胖相关蛋白(FTO)和AlkB同源物5(ALKBH5)。Readers则是负责“读取”RNA甲基化修饰的信息,并参与下游RNA的翻译、降解等过程,如YTH家族蛋白YTHDF1-3、RNA结合蛋白异质核蛋白A2B1(HNRNPA2B1)和真核转录起始因子 3(EIF3)。
胰岛素样生长因子2-mRNA结合蛋白家族(insulinlike growth factor 2 mRNA-binding protein,IGF2BPs)是近年新发现的一类 m6A“reader”,包含 IGF2BP1~3。该蛋白家族可通过识别靶mRNA上的m6A修饰,增强靶mRNA稳定性并促进其翻译[7]。其中,IGF2BP1的致癌作用最强,可以增强肿瘤细胞的增殖、转移等能力[8]。有研究表明IGF2BP1可作为癌基因MYC转录增强子,促进其稳定和翻译[9]。此外,IGF2BP1还可以作用于靶mRNA的3′UTR端,干扰miRNA对mRNA的调控作用,例如可以削弱miRNA对LIN28B、SIRT1和MAPK6等基因的降解作用[8]。……
