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暗褐网柄牛肝菌高多态性SSR标记的开发

2021-01-14何明霞张春霞许欣景

热带农业科技 2021年1期

高 锋,何明霞,张春霞,刘 静,许欣景,曹 旸

(1.云南省热带作物科学研究所,云南景洪666100;2.云南省景洪宏臻农业科技有限公司,云南景洪666100)

暗褐网柄牛肝菌Phlebopus portentosus(Berk.&Broomo)Boedijn,又名黑牛肝菌,隶属于担子菌门(Basidiomycota)伞菌(Agaricomycetes)牛肝菌目(Boletales)小牛肝菌科(Boletinellaceae)脉柄牛肝菌属(Phlebopus),分布于斯里兰卡、越南、印度尼西亚、泰国、巴西、墨西哥、澳大利亚、新西兰等国家,国内的广西、海南、云南等省区都有分布[1-7]。其子实体味道鲜美,营养丰富,具有很高的经济价值。相对于其他的分子标记,SSR标记的变异速度更快,适用于食用菌生产菌株的鉴定及遗传多样性的分析。在前期的工作中,我们使用由基因组数据开发的15个SSR标记对33个生产菌株进行了鉴定,由于样品数量及采样范围的影响,仅有5个标记表现出了中度多态性特征[8]。为此,在进一步的工作中,我们扩大了SSR标记及样品的筛选范围,以期寻找到具有更好的多态性、稳定性和重复性,能够更充分反映暗褐网柄牛肝菌遗传多样性及群体遗传学特征的SSR分子标记。

1 材料和方法

1.1 样品来源

157样品来自12个地理群体,涉及云南、广西、四川三个省区,部分来自澳大利亚和新西兰。

1.2 基于基因组数据的SSR引物设计和筛选

根据文献资料,SSR单元的重复次数越高,其具有高多态性的可能越大[9]。因此,本次开发标记主要针对二碱基重复10次以上,三碱基重复7次以上,四碱基重复6次以上,五碱基重复6次以上,及六碱基重复6次以上的SSR标记,PCR产物长度小于600 bp。具体步骤如下:

a.运用MISA软件搜索SSR,以暗褐网柄……

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