施亚磊，于静芳，吴 珂，周 俊*

（1. 华南师范大学生物光子学研究院，激光生命科学教育部重点实验室，广州 510631；2. 华南师范大学生物光子学研究院，广东省激光生命科学重点实验室，广州 510631；3. 河南大学生命科学学院，开封 475004）

拟南芥（Arabidopsis thaliana）作为模式生物已有将近50年的历史，被广泛应用于植物生物学的遗传发育研究。拟南芥是二倍体，含有5对染色体，大约27 655个蛋白编码基因［1］。目前，基于正向遗传学（forward genetics）的突变体筛选仍然是遗传研究中十分重要的手段，通过自发突变或人工诱变获得感兴趣的表型性状改变，然后找到这些特定性状变化所对应的突变基因，并揭示其生物学功能。由此可见，鉴定异常表型的基因突变是解决植物生物学问题的关键一步，然而该过程通常是困难并且费时的。目前，在拟南芥的研究中已经发展出很多方法来鉴定突变基因。其中，图位克隆是较常用的方法，它依赖于染色体上位置已知的遗传或分子标记［2-3］。分子标记多指DNA标记，是能够鉴定区别个体或物种差异的染色体上的DNA序列，其源自于不同类型的突变，如插入、缺失、替换、重构或随机重复DNA的复制错误等［4］。分子标记种类很多，如简单序列长度多态性（simple sequence length polymorphism, SSLP）、扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism, AFLP）、酶切扩增多态性（cleaved amplified polymorphisms, CAPS）、限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism, RFLP）、随机扩增多态性 DNA（random amplified polymorphic DNA,RAPD）、简单重复序列（simple sequence repeat, SSR）和单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）等［5-8］。可靠分子标记的开发将极大地促进拟南芥的图位克隆。

插入或缺失（insertion/deletion, INDEL）标记是常用的基于聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）的分子标记。……