董 辉,杨 莉,李 莉,张建军,范婧芳,宋世佳,杨 雷,李海山

(1.河北省农林科学院 石家庄果树研究所,河北 石家庄 050061;2.河北省农林科学院,河北 石家庄 050031;3.河北省植保植检总站,河北 石家庄 050035)

栽培草莓(Fragaria×ananassa, 2n=8X=56)是蔷薇科草莓属的多年生草本植物,是重要的经济作物,在世界范围内广泛栽培。中国是世界草莓第一生产国,种植面积和产量均居世界第一[1]。栽培草莓起源于智利草莓(Fragariachiloensis)和弗州草莓(Fragariavirginiana)的偶然杂交[2],为异源八倍体,相较于二倍体作物其遗传背景复杂,相关的遗传育种研究具有一定难度。近年来,AFLP、SCAR、SSR等分子标记技术被广泛用于栽培草莓遗传图谱的构建和数量性状的QTL定位、遗传进化分析及亲缘关系鉴定[3-5],Weebadde等[6]构建了429个标记定位的总图距1 541 cM的AFLP图谱,van Dijk等[7]构建了508个标记定位的总图距1 846 cM的SSR图谱,此外还包括多个标记相结合绘制的整合图谱[8],但是由于标记本身的特性和数量限制,构建的图谱密度和饱和度较低。

随着新一代测序技术(NGS)的发展以及SNP标记的开发利用,使得利用SNP标记构建遗传图谱成为可能,图谱从质量和清晰度上都有了很大的提高。近年来,这项技术也逐渐应用于栽培草莓中。2015年,Bassil等[9]在栽培草莓中获得了6 594个标记定位的总图距2 050 cM的SNP图谱。2017年,Nagano等[10]在栽培草莓中获得了11 574个标记定位的总图距2 816.5 cM的SNP和SSR的整合图谱。

本研究利用石家庄果树研究所自育高抗白粉病草莓品种红星为母本,日本高感白粉病草莓品种红颜为父本构建F1群体,通过SLAF-seq技术对栽培草莓F1群体进行高通量测序和SNP标记的开发,构建了高密度SNP遗传图谱,并对其特征和应用进行了分析研究。……