张强 王悦 李美秋 郑健

组学是基于高通量分析的集合生物学系统，根据分析目标的不同可分为基因组、转录组、蛋白组、代谢组和RNA组等，以整体角度去研究生物体内DNA转录、RNA翻译、蛋白质修饰和代谢产物的功能等情况。目前多组学的发展也实现了各个数据的互补，解决了人类利用单一组学无法解决的问题，使人类对生物体的表达信息研究更透彻。

1 基因组学

基因组学是由美国科学家Thomas Roderick于1986年提出的，指对所有基因进行基因组作图(包括遗传图谱、物理图谱、转录本图谱)、核昔酸序列分析、基因定位和基因功能分析的一门科学[1]。自21世纪以来，作为世界上最有影响力的学科，并不只限于生物学的范畴，而是与其他学科相互融合，不断发展新技术、新领域。通过基因组测序和DNA微阵列技术可以更深地了解一个物种的分子进化、系统发育和基因调控等特点。其中基因组测序的核心：第二代测序技术(NGS)，它能够捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列，可以快速高效的鉴别单核苷酸多态性(SNPs)标记、插入和缺失(InDel)标记等[2]。Peterson等[3]利用双酶切系统的基因组测序技术在鹿鼠的2个姐妹物种的杂交群体中共获得了1 000多个SNPs，且具有固定差异，并利用1 000多个SNPs构建了遗传图谱。DNA微阵列则可以高通量检测分析DNA结合蛋白与大量DNA分子相互作用，用以确定转录因子的DNA结合亲和性、特异性及序列偏好性[4]。Wong等[5]将DNA微阵列技术与最新的一种转录因子DNA结合特异性高通量表征技术-SELEX-Seq相结合，表征了转录因子NF-κB的9种二聚体与各种11-mer序列的结合亲和性，进一步鉴定基因调控区中与性状、疾病相关的重要SNP。……