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基于DNA四面体纳米结构探针的电化学生物传感器检测DNA甲基化

2020-12-29韩苗苗席守民

分析测试学报 2020年12期
关键词:检测

韩苗苗,王 萍,席守民

(河南科技大学 基础医学院,河南 洛阳 471000)

DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传修饰之一。它是指在DNA甲基转移酶(DNMT)的催化作用下,以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)作为甲基供体,将甲基基团结合到胞嘧啶的C-5位,在胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)二核苷酸中形成5-甲基胞嘧啶(5-mc)的过程。在真核生物DNA中,约3%~8%的胞嘧啶残基被甲基化[1],而异常的甲基化状态(低甲基化或高甲基化)又与多种疾病的发生密切相关,如糖尿病[2]、冠状动脉疾病[3-4]、帕金森氏症[5]、肿瘤[6-7]等。因此,DNA甲基化的检测对于这些疾病的预测和预后具有重要意义。

目前已经建立了许多用于检测DNA甲基化的方法,常用的方法包括亚硫酸氢盐测序法[8]、甲基化特异性PCR(MSP)[9-10]、甲基化敏感性限制性内切酶-PCR(MSRE-PCR)[11-12]、甲基化敏感的高分辨率熔解曲线分析(MS-HRM)[13-14]和变性高效液相色谱(DHPLC)[15-16]。尽管亚硫酸氢盐测序法被认为是DNA甲基化分析的金标准,但它通常需要大量的基因组DNA作为起始物质,并且在修饰过程中存在DNA降解的固有问题[17]。此外,上述所有方法都依赖于PCR设备的使用,使得这些方法成本昂贵、费力、费时且复杂。为了克服常规DNA甲基化检测方法的缺点,已出现了一些用于DNA甲基化检测的新方法,如比色法[18-19]、基于荧光的生物传感器[20-21]、电化学发光法[22]、表面等离子体共振(SPR)生物传感器[23-24]、电化学法[25-28]等。其中,基于电化学的DNA甲基化分析方法因其操作简便、灵敏度高、成本低且易于自动化和便携化等优点而受到了广泛关注[29]。

电化学生物传感器捕获探针的结构对检测灵敏度和特异性至关重要。……

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