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CRISPR/AsCpf1 双切刻系统构建初探

2020-12-21辛京京李和刚秦怀远赵金山

中国畜牧杂志 2020年12期
关键词:实验

辛京京,李和刚,秦怀远,张 宁,赵金山

(青岛农业大学动物科技学院,山东青岛 266109)

CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short palindromic Repeats)是在生命进化的历程中产生的,它是细菌和病毒长期竞争的产物。病毒以细菌为载体,把自己的基因导入到细菌当中,通过细菌复制达到病毒基因复制的目的;细菌为了消除自身染色体上的病毒基因[1-3],进化出独特的CRISPR 系统。CRISPR 系统克服了传统基因编辑打靶效率低、实验周期长及应用范围窄等缺点,凭借高效、操作简单等优势在生物学领域获得广泛应用[4-7],这种简单的RNA 导向基因编辑技术已成为生物学中的革命性工具。

Zetsche 等[8]研究发现了一种使CRISPR 技术更简单、更准确的方法,即CRISPR/Cpf1 系统。Cpf1 是由一条crRNA 引导的v 型Cas 内切核酸酶,它相对于Cas9 具有多方面的优势,包括分子量大小、剪切方式、剪切位置等。Cpf1 拥有广阔前景,但仍有一些亟需解决的技术问题,比如依然存在脱靶效应[9],因此可以考虑将Cpf1 蛋白改造成Double nickase(双切刻酶),以进一步降低脱靶效应。

Ran 等[10]将Cas9 切刻酶突变体与配对的向导RNA 组合以引入靶向的双链断裂,实验证明使用成对的单链切口可以将细胞系中的脱靶活性降低50~1 000倍。与此类似,Takashi 等[11]研究发现,R1226A(精氨酸突变为丙氨酸)突变体产生切刻酶,切割非靶DNA 链而不是靶链(即只切割单链)。另外,由于野生型Cpf1 识别的PAM 为TTTV,此类识别位点比较稀少,如果简单通过R1226A 的突变来组合双切刻系统,要找到合适的基因编辑靶位点不太容易;针对这一问题,可以考虑在Cpf1 RR 突变体(识别PAM 为TYCV)[12]基础上进行改造,适当拓展双切刻系统的靶标范围。……

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