黄 薇，廖 茜，罗土炎，宋永康*

(1.福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/福建省农产品质量安全重点实验室，福建 福州 350003； 2.福建省食品药品质量检验研究院， 福建 福州 350005)

抗生素抗性基因(antibiotics resistance genes，ARGs)作为一种新型环境污染物，因其有自我扩增、容易转移给其他细胞等生物学特征，在2015年已被世界卫生组织(WHO)列为人类医疗健康面临的三大威胁之一。世界卫生组织(WHO)宣布将在全球范围内对控制ARGs进行战略部署[1]。目前，在水产养殖各种不同环境介质中(水体、土壤、沉积物)均有ARGs检出的报道，水产养殖场已经成为环境中ARGs的储存库[2-3]。作为一个水产养殖大国，在当前抗生素与ARGs污染日趋严峻的形势下，加强水产养殖环境中ARGs的污染情况研究力度已刻不容缓，也责无旁贷[4]。

传统检测环境ARGs的方法主要是通过ARGs的PCR、定量PCR以及耐药菌的培养筛选等，通过这些方法研究人员已经从不同环境介质中分离和鉴定了大量的ARGs，阐释了不同ARGs的作用机制[5]。但是，传统的研究分析方法具有一定的限制性，如大多的微生物不可培养、PCR结果的真实程度取决于设计引物的序列等，因此很难得到环境中微生物抗生素抗性基因组的全面和详细的信息。近年来，基于功能的宏基因组筛选和基于高通量测序为基础的宏基因组测序分析技术与方法的发展为研究环境抗生素抗性基因组的生态、起源、进化和传播机制提供了最强有力的工具[6-7]。Wang等[8]和Fang等[9]利用高通量宏基因组测序分析技术使人们对海水养殖场以及养猪场所蕴藏ARGs的种类、分布和传播途径都有了更进一步的理解。……