Excel软件结合Visual Basic编程工具探索MicroRNA-501对肺鳞癌患者生存情况的影响
2020-10-24黄致远江文豪杨福贵汪令伟冯明昊王光学李钦传
黄致远,江文豪,杨福贵,朱 磊,董 林,汪令伟,冯明昊,魏 亮,王光学*,李钦传,*
1.同济大学附属东方医院心胸外科(上海 200120)
2.同济大学附属东方医院转化医学研究中心(上海 200120)
非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer, NSCLC)是肺癌的主要类型,约占所有病例的80%[1]。NSCLC包括几个组织学亚型,如腺癌、鳞状细胞癌和大细胞癌。microRNA(miRNAs)是19-25个核苷酸长的单链非编码RNA,通常通过与3’非翻译区域(3’-UTR)结合在转录后水平负调控基因表达[2-3]。人们发现在肝细胞癌和前列腺癌中miR-501-3p可能起抑癌作用[4-5]。此外,miRNA微阵列研究表明,miR-501-3p与肺癌骨转移相关[6]。生存分析是探究microRNA表达情况对肿瘤患者生存时间影响大小的常用方法。目前科研工作者在需要使用生存分析相关操作的时候多使用SPSS等专业的统计软件[7-8],其缺点在于专业性高、操作性差。Excel软件由美国的Microsoft公司开发,在全世界普遍使用,可以实现一般的t检验,F检验,线性回归和方差分析等常见统计方法[9-12]。本文旨在利用Excel软件中自带的Visual Basic(VBA)编程功能,分析肺鳞癌患者组织中的miR-501表达水平与患者生存时间之间的关系。
1 资料与方法
1.1 获取数据
登录https://kmplot.com/analysis/网站,点击start miRPower for pan-cancer按钮,在新页面的Gene symbol框中输入hsa-miR-501。在Split patients by选项中选择median,使用肿瘤组织中has-miR-501表达量的中位数区分高表达和低表达,在plot options中选择Export plot data as text并在癌症类型中勾选Lung squamous cell carcinoma。其余选项保持默认即可。点击Draw Kaplan-meier plot按钮。在新页面中点击Export plot data as text即可获得原始数据,见图1。

图1 数据格式Figure 1.Data Format
1.2 Kaplan-Meier法生存分析的介绍
Kaplan-Meier法又称为乘积极限法,用于未分组资料的生存分析,是一个充分考虑了在不同的分组中可能有患者中途退出实验时候的统计学处理方法。……
