两种表征核酸适配体-靶蛋白亲和作用的毛细管电泳方法比较
2020-08-26孟庆威谢剑炜
色谱 2020年9期
孟庆威, 郭 磊, 谢剑炜
(1. 军事科学院军事医学研究院毒物药物研究所, 抗毒药物与毒理学国家重点实验室, 北京 100850;2. 东曜药业有限公司, 江苏 苏州 215024)
核酸适配体是一类通过指数富集配体的系统进化技术得到的单链寡核苷酸(RNA或单链DNA, ssDNA),是分析化学、生物医学领域内一类重要的“明星分子”,在分析传感、治疗药物、临床诊断等方面开展了多样化探索实践[1]。与抗体抗原亲和识别方式比较,相似的是,适配体与靶分子间亦具备空间互补之特征,经多种静电、疏水等作用力产生特异性识别;不同的是,适配体作为寡核苷酸分子本身,存在结构易变性、多样性,其三维结构受体系微环境,如界面特性、溶液离子种类/浓度等调控的影响较为显著,某种程度上对适配体的具体应用造成了一定阻碍[2]。目前认为,对于适配体及其靶分子,最好利用至少两种方法进行相互作用评价,以深入理解其作用方式及特性。
目前常见的互作评价技术包括荧光、凝胶电泳迁移率变动分析、CE、等温滴定量热法、表面等离子体共振等[3,4],其中CE技术因其多模式方法、体系生物相容性强的特点,已成功发展了亲和CE(ACE)、CE-前沿分析(FA)、预平衡-毛细管区带电泳(PE-CZE)等多种评价方法[5,6]。例如,近年来Krylov课题组[7,8]发展了一系列动力学CE方法,从CE分离状态中的复合物形成和解离的偏微分方程解析解入手,可针对单张谱图,从平衡混合物的非平衡CE(NECEEM,也即PE-CZE)[9]、柱塞-柱塞动力学CE[10]等多种模式同时求解解离常数(Kd)和动力学速率常数。……
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