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基于多数据库分析ANK3 在肾透明细胞癌中的作用

2020-08-13张大军叶向东

医药前沿 2020年12期
关键词:数据库差异分析

张大军 叶向东

(顺德和平外科医院泌尿外科 广东 佛山 528300)

肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是肾癌的最常见类型,起源于肾小管上皮细胞[1],部分ccRCC 患者早期起病隐匿,错过手术时机,且ccRCC 对放化疗不敏感[2],靶向治疗非常重要,因此ccRCC 的早期诊断和治疗靶点的研究非常重要。

锚蛋白重复序列3(ANK3),又被称为MRT37。目前ANK3 的研究集中在精神疾病[3]。其与前列腺癌[4]、膀胱癌[5]有关,在肾癌中尚无报道。本研究通过数据分析,探索ANK3 在ccRCC 中的表达及对临床、预后的影响。

1.资料与方法

1.1 在Oncomine 数据库中分析ANK3 在ccRCC 中的表达差异。从TCGA 数据库下载ccRCC 患者临床、预后及转录组数据,以 ANK3 表达中位数分为高低表达组,比较组间临床指标差异,并进行生存分析。

1.2 统计学方法

使用R 软件进行分析。组间比较采用χ2检验,生存分析采用KM 法。P<0.05 为差异存在统计学意义。

2.结果

2.1 Oncomine 数据库有9 项关于ANK3 在ccRCC 中表达差异的研究(表1)。荟萃分析这9 项研究,提示ANK3 在ccRCC 中表达量下降(P=2.59×10-7)。

表1 ANK3 在ccRCC 中的表达差异研究

2.2 TCGA 数据库有537 例ccRCC 样本,比较临床指标的组间差异(表2)。提示ANK3 表达量与淋巴侵犯无关,但低表达与患者男性、年龄大、分期晚、远处转移、低分化及血小板升高有关。

表2 ANK3 与ccRCC 临床信息关系

2.3 生存分析结果提示,ANK3表达量可影响患者总体生存率,高表达患者总体生存率更高(n=537, Logrank P=5.7×10-11)。

3.讨论

ccRCC 是肾实质来源的恶性肿瘤,缺乏早期诊断标志,从基因层面研究有助于发现早期诊断指标、治疗靶点。关于ANK3 的研究集中在精神疾病领域。有研究报道ANK3 与肺、结肠、乳腺、膀胱及前列腺肿瘤有关,但在肾癌中尚未见报道。……

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