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3D基因组结构能显著影响脆性位点基因组的稳定性(2020.7.20 Plant Biotechnology Journal)

2020-08-09

三农资讯半月报 2020年14期
关键词:特征区域结构

动物细胞中的复制被组织成具有相似复制时间的离散区域,由多个复制起点及其相关复制子组成,复制子的大小从30kb到450kb不等。不同的DNA复制的时期不一样,有复制早期和复制晚期。复制时间(replication timeing)是非常严格的,以确保基因组的忠实复制。任何导致DNA损伤高水平发生的条件也都会引发复制应激(replication stress)。复制应激导致复制叉进展减少,分叉停滞,休眠起源激活。然而,休眠起源激活并不总是足够的,受干扰的复制在称为普通型脆性位点(CFSs)的特定区域引起染色体不稳定。在轻度复制胁迫下,CFSs表现为中期染色体的断裂、间隙和收缩。CFS不稳定性是DNA复制完成前有丝分裂进入的结果,造成DNA断裂和DNA损伤反应激活。未能在CFSs上完成复制和DNA损伤的修复,导致损伤和基因组不稳定在细胞世代之间的传递。

CFSs的几个特征被认为有助于CFS的表达(脆性),包括晚期复制和缺乏复制起源,这些在复制压力下阻碍了它们的复制完成。由富AT序列诱导的DNA二级结构也被认为是通过提高复制叉的潜在障碍来引起CFS的表达。此外,CFSs富含大基因,这可能导致由于复制-转录碰撞而导致的脆性。然而,所有的因素本身都不足以诱发脆性,因为它们在整个基因组中普遍存在,包括非脆性区域。此外,这些脆性位点特征不能解释所有已知的CFSs。因此,复发性染色体不稳定的分子基础尚不清楚。染色体结构被认为在维持基因组稳定性方面起着重要作用,通过调节DNA损伤响應信号的传播来控制损伤修复,例如TADs内的γH2AX,其突出的趋势是在TAD边界停止。……

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