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枯萎病土壤微生物特征解析及发病预测方面取得重要进展(2020.7.18 Plant Biotechnology Journal)

2020-08-09

三农资讯半月报 2020年14期
关键词:特征研究

镰刀菌枯萎病作为土传病害的典型代表,在世界范围内的多种作物频繁爆发。在过去的几十年里,相关学者进行了大量案例研究发现,尽管枯萎病爆发与土壤中病原菌丰度呈正相关关系,但并不存在可以确定是否发病的阈值。土壤是一个化学组成复杂、物理相系交错、生物及功能神秘的体系,对镰刀菌的存活及致病能力影响难以揭示,但普遍认为土壤抑病功能很难从个别微生物及功能上说明问题。因此,从分子生态学角度出发,以整合分析的方法来解析发病土壤微生物群落的普遍性特征,有望能为更好地防控土传枯萎病提供解决方案。

当地时间7月17日,南京农业大学沈其荣教授课题组通过对全球1500多个土壤测序样品的整合分析,在枯萎病土壤微生物特征解析及发病预测方面取得重要进展。研究结果以“Predicting disease occurrence withhighaccuracybased on soil macroecological patterns of Fusarium wilt”為题发表在国际微生物领域顶级期刊《The ISME Jounal》上。课题组袁军博士和博士生文涛为论文共同第一作者,沈其荣教授为通讯作者,美国亚利桑那州立大学的C Ryan Penton和美国农业部的Linda Thomashow参与了该项研究。

研究发现,较高的尖孢镰刀菌相对丰度是发病土壤的一个重要特征,但无法用于区分土壤的健康程度;健康土壤中非致病性镰刀菌和链霉菌相对丰度较高,表明其可能与维持土壤健康有关。该研究在解释群落特征的基础上,使用机器学习分别构建了细菌和真菌模型,该两种模型在区分健康和发病土壤方面准确度高达85%以上。……

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