MALDI-TOF-MS和RT-qPCR对于SLCO1B1和ApoE多态性检测的比较
2020-07-09叶阿里邹雨桐张海燕张晓峰马庆伟
叶阿里,邹雨桐,张海燕,吴 洁,张 睿,张晓峰,马庆伟
(1.中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院 检验科, 北京 100730; 2.北京毅新博创生物科技有限公司, 北京 102206)
他汀类药物(statins)是临床常用的调脂药物之一,也是预防心血管疾病风险的首选用药[1]。然而,他汀类药物的治疗效果和临床适用性存在明显的个体差异,他汀相关性肌病(statin-associated muscle symptoms,SAMS)是最普遍的他汀药物不良反应[2]。SLCO1B1编码有机阴离子转运多肽(OATP1B1),主要定位于人类肝细胞膜上,介导他汀类药物的转运[3],研究表明SLCO1B1单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP),rs2306283(388A>G)和rs4149056(521T>C) 与SAMS密切相关[4]。另一个与他汀药物疗效相关的基因是ApoE,其表达产物载脂蛋白E通过与LDL受体结合,调控胆固醇和其他脂质的转运。ApoE的SNP位点rs429358(388T>C)和rs7412 (526C>T),可构成ε3(388T-526C), ε2(388T-526T)和ε4(388C-526C) 3种单倍体,及6种基因型:ε2ε2、ε2ε3、ε2ε4、ε3ε3、ε3ε4、ε4ε4。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)是目前临床实验室最常用的检测SLCO1B1和ApoE多态性的技术,然而该方法仅适用于个别SNP位点的检测。近年来,核酸质谱技术在基因组学领域得到了飞速发展,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)因其可同时完成多个SNP位点的检测,准确性高、成本较低等优势已逐渐成为SNP分析的新方法。本研究通过对MALDI-TOF-MS和RT-qPCR两种技术进行方法学比对,评价MALDI-TOF-MS是否能应用于临床脂质和药物代谢相关基因的检测,从而指导临床他汀类药物的使用。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 病例:选取2018年7月至2018年9月在北京协和医院就诊,临床诊断为高脂血症、高血压或动脉粥样硬化的患者71例,其中男性32例,女性39例。收取其常规检测后剩余无污染的EDTA抗凝外周血标本,用于后续基因组DNA提取和基因多态性检测。纳入者的……
