汤山松 刘娟

1资阳市人民医院肿瘤科641300;2四川省人民医院病理科,成都610000

肺癌是临床上最为常见的恶性肿瘤,其发病率在男性为第一位,女性为第二位,且病死率位居所有肿瘤的第一位[1]。一直以来,肺癌都是影响人类生存健康的重大难题之一。近期发布的全球癌症统计报告显示,肺癌、气管和支气管肿瘤发病率及病死率居各种癌症之首位[2]。因此,找出特异度、敏感度更高的蛋白及基因标志物,对于肺癌的早期诊治及评估预后具有重要价值。

近些年的研究表明S100P 在人类多种恶性肿瘤中呈现明显上调表达,并与患者肿瘤病理学特征存在一定的关系[3]。然而S100P 在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者肿瘤组织和癌旁组织中的表达情况及其与NSCLC 患者生存关系研究鲜有报道。本研究采用生物信息学方法分析TCGA 数据库中S100P的表达水平及其高低表达与NSCLC 患者总生存期 (overall survival,OS)和无疾病进展生存期 (disease free survival,DFS)的关系。同时,采用免疫组织化学法检测48例NSCLC患者肿瘤组织中S100P 蛋白表达水平,并分析其与患者临床病理特征的关系,对前述生物信息分析结果进行验证。

1 对象与方法

1.1 S100P表达水平分析 在TCGA 数据库中分析“肺癌”“非小细胞肺癌” “鳞癌” “腺癌”和“S100P基因”检索物种为人类,分析S100P 基因在多种组织中的变动情况,并比较其在肿瘤组织和对应的癌旁正常组织中的差异表达情况。认为存在组织差异表达的条件为S100P基因m RNA 上调或下调表达超过2 倍 (|Log2FC|＞1),且P＜0.05[4]。

1.2 S100P 蛋白网络分析 采用STRING 数据库,与S100P相互作用蛋白网络,并分析其相关蛋白聚类情况,S100P 蛋白-蛋白相互作用网络构建条件为置信度大于0.5,相互作用来源为共表达、基因功能和比邻关系[5]。……