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雉鸡微卫星多态性分析

2020-05-21赵乐乐袁红艳张春华陆雪林

养殖与饲料 2020年2期

邢 磊 赵乐乐 袁红艳 张春华 陆雪林*

1.上海市动物疫病预防控制中心,上海201103;2.上海欣灏珍禽育种有限公司,上海201408

微卫星(SSR)标记技术对加快畜禽性状选育有很大的优势[1],关于雉鸡的分子标记研究以前尚未有过,而且雉鸡的基因组信息也是未知的。因此,本研究利用高通量测序技术以雉鸡基因组为研究对象对雉鸡的SSR 分子标记进行开发,构建出雉鸡SSR 分子标记数据库,迈开了进行雉鸡分子标记遗传研究的第一步。通过设计特异性引物并经过样本群体的多态性验证[2],得到了可靠的多态性SSR 标记,旨在为雉鸡种质资源遗传多样性研究、基因定位以及分子标记辅助育种提供分子水平上的有效工具[3]。

1 材料与方法

1.1 试验动物

试验动物来源于上海欣灏珍禽育种有限公司饲养的中华环颈雉(RN)、蒙古雉(MX)和国内雉鸡(D)的纯种后代。3 个品种在同一鸡舍、相同管理条件下饲养。

1.2 血液样本采集及基因组提取

第20 周时,从试验群体中随机挑选105 只母鸡采集血样,各样本翅静脉取血3 mL,4% EDTA抗凝剂抗凝,-20 ℃保存。利用试剂盒法(天根生化(DP318)血液基因组提取试剂盒)提取血样基因组,采用TBS380 结合picogreen 进行浓度和纯度检测,再根据浓度检测结果利用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测样本DNA 的完整性,电压120 V,时间20 min。所得DNA 于-20 ℃储存备用。

1.3 微卫星标记的引物设计及筛选

通过454 平台高通量测序,利用MISA 程序在序列中搜索SSR 位点,利用primer3_2.2.3 对搜索得到的SSR 位点设计特异性引物。扩增目标片段为重复序列前1 个碱基到后5 个碱基的片段,扩增产物长度在100~400 bp 之间。……

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