舞毒蛾标本DNA提取和COI基因扩增
2020-04-21王鸿斌李国宏
徐 瑶,王鸿斌,王 梅,李国宏
(1. 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所 国家林业局森林保护重点实验室,北京 100091;2. 中国农业大学昆虫学系,北京100193)
世界各地的生物博物馆保存有数百万个标本,其包含了时间和空间上不同历史阶段广泛的生物群,提供了生物多样性的丰富记录[1-2],是生物分类学、生物地理学和生物系统学研究的重要组成部分[3-7]。同时,博物馆标本为物种进化研究提供了难以置信的潜力[8],历史标本与现生标本的结合可以揭示物种在一定时间尺度上以响应环境压力在表现型或基因型上发生的变化[9-10]。随着分子生物学、基因组学以及相关统计工具的发展,标本中更多的分子数据正在被挖掘和利用,例如对博物馆标本中基因序列的分析能够标识目前形成的物种遗传多样性的过程[11];将从模式标本获得的序列作为新物种描述和分类修订的附加数据来源,可增加物种识别的准确性并加快物种分类的过程等[12-13]。然而,标本中低浓度和小片段的DNA限制了从其中获得基因序列的能力[14-15]。因此,前人做了很多关于标本DNA提取方法的研究[16-19]。Guzman-Larraldeet al[19]评价了 DNeasy®Blood& Tissue Kit、改良DNeasy®Blood& Tissue Kit、CaCl2法、改良 CaCl2法和HotSHOT法5种方法对乙醇保存昆虫标本的DNA提取效果。魏亦寒等[20]用了4种方法(CTAB法、SDS法、磁珠法以及GeneJET基因组DNA纯化试剂盒)对扶桑绵粉蚧成虫的新鲜样本以及乙醇保存标本进行DNA的分离提取,并对4种方法的DNA提取效果进行了比较分析。Hunter等人[21]在提取双翅目昆虫标本的DNA时将裂解液用超声波处理。……
