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新型冠状病毒的自述

2020-03-27任文琳龚明丽丁强

大众健康 2020年3期
关键词:蛋白酶宿主受体

任文琳 龚明丽 丁强

大家好,我是新型冠状病毒,引起新冠肺炎的罪魁祸首。这些日子,我天天上新闻,每天大家谈论最多的也是我。但不打不成交,借这次机会,我详细做个自我介绍,

我属于套式病毒目冠状病毒科中的乙型冠状病毒属(Betacoronavirus)。在这个属里,我有几个兄弟,大家比较熟悉的是2003年引起SARS的SARSCoV,和2012年引起MERS(中东呼吸综合征)的MERS-CoV。

其中,SARS-CoV是我的“亲哥”,我们有很多类似地方:都通过相同的方式进入宿主细胞启动感染。SARS-CoV在2003年之后,就过起了隐居的生活。而我“堂哥”MERS-CoV,脾气暴躁,时不时就会闯进公众视野,引起的疾病也比较严重,并且致死率也高,达到35%。

本来,我们默默地在自己的地盘过着无忧无虑的生活,不想危害任何生物。没想到,人类的活动能力和范围不断增强和扩大,严重威胁到我们。比如,有些人爱吃野味,抓走我们的宿主,不停地侵犯我们的生存空间,惹得我的兄弟们怒发冲冠,多次出来惩罚这些人,但是人类还是恶习难改。

而这次我也拍案而起!希望此后人类能警钟长鸣,不要再侵犯野生动物,我们也就不攻击人类了。

我的样子

我和其他冠状病毒兄弟们差不多,呈球状,直径约为100纳米~160纳米,人类利用一种可以放大很多倍的电子显微镜才能看到我的样子。人类觉得我们酷似一顶王冠,因此取名冠状病毒。

我的身体是由蛋白质和核酸组成的。最外面是刺突蛋白(Spike,S),这是维持我的体型和身材(病毒颗粒形态)非常重要的蛋白;再往里是E和M蛋白。这些都是撑起病毒颗粒形状的重要蛋白。最里面就是对于我繁衍生息最重要的遗传物质RNA,它被N蛋白包裹并保护着。就是这些蛋白和RNA组成了具有感染性、可以引起疾病的病毒颗粒。

我的基因

我的遗传信息,也就是基因,都保存在一段单链RNA上,也称为我的基因组RNA。我一生中所有生理过程需要的蛋白质可以粗略地分为结构蛋白、非结构蛋白和辅助蛋白。

我主要介绍一下结构蛋白,这是维持病毒颗粒结构重要的组分,特别要提的是位于病毒颗粒最外面的S蛋白。我必须要依靠S蛋白和宿主细胞受体相互作用才能进入宿主细胞,开始感染。宿主细胞受体就好比是我进入细胞要经过的大门的锁,S就相当于我打开这把锁的钥匙。所谓“一把钥匙开一把锁”,我和我“亲哥”SARS-CoV都是通过血管紧张素转换酶2(ACE2)这个受体开启细胞大门的,而我“堂哥”MERS-CoV是通过二肽基肽酶4(DDP4)这个受体进入宿主细胞的。

不同物种编码出来的ACE2蛋白也有差别。因此,我这把S蛋白的“钥匙”,也不是能任意开某个物种的ACE2蛋白这把“锁”的。这就决定了我们对所感染宿主的偏好性。

比如,最近武汉病毒所石正丽团队就发现我们的S蛋白可以开启人、果子狸以及蝙蝠的ACE2蛋白,但是不能开启小鼠的ACE2,所以我们不能也不会去感染小鼠。

我们只能感染某些宿主的一些特定器官组织,不能随便选择宿主和感染的器官,这就是“遗传屏障”。但是我们的S基因在不停进化,宿主也在不停进化,这种变化是有可能打破“遗传屏障”的,使得我们侵染的宿主物种范围扩大,造成病毒的跨种传播。

还有一种情况,就是病毒本来就能识别人类的受体,而我们本来是和人类“划地而治”,寄生在野生动物体内,躲在深山老林隐居。但是还是有些人有捕杀野生动物的恶习,让病毒有机会和人类接触,造成了跨种传播。

此外,我依靠 “非结构蛋白”完成繁衍生息、传宗接代的生理过程。“辅助蛋白”是多种小蛋白的统称,主要是蒙骗宿主细胞抗病毒的免疫系统,帮助我更方便、更高效地完成各个生理过程。

我的一生

我的一生其实非常短暂,以小时来计算。但是,我可以在短时间内把自己克隆成千上万份,孙悟空浑身的毛拔光了变出来的猴子也没我的子代病毒多。简单来说,我这一生有这么几步:

首先,我要进入细胞。病毒的进入是病毒感染至关重要的一步,因此刚才提到的病毒S蛋白和细胞受体也是预防和治疗病毒感染的关键靶点。

其次,进入细胞后,我会将遗传物质RNA释放出来。它可以作为模板,在宿主核糖体的帮助下,直接翻译产生一个很长的“非结构蛋白”。这个长的“非结构蛋白”,进一步将自己切割成多个蛋白,只有被切开,才能分别到自己的岗位上执行功能。

最后,在酶的帮助下组装的N、 M、 S蛋白,有条不紊地将新合成的子代病毒基因组RNA组装成病毒颗粒,通过细胞的转运机器,释放到细胞外。

我的克星

所谓“知己知彼,百战不殆”,科学家们通过辛勤的科研劳动,清楚认识了我的一生,并有针对性地设计了很多对付我的方法。

设置拦路虎——抑制病毒进入细胞

最常用的抑制病毒进入细胞的方法就是采用生物技术的手段,做成亚单位疫苗或者病毒载体疫苗。疫苗免疫人体后,人体内就会产生针对S蛋白的特异性中和抗体。当真正的病毒感染细胞后,人体的中和抗体可以迅速结合病毒S蛋白,使其不能有效地和宿主细胞受体相互作用,从而大大抑制了病毒进入细胞。目前清华大学医学院张林琦教授团队正在紧锣密鼓地研究此类疫苗。

还有一种方案,就是在康复病人的体内,寻找产生针对S蛋白中和性抗体的B细胞,得到编码中和性抗体的基因序列,采用生物工程手段,在体外大量生产中和性抗体,再输入人体。这也可以在一定时间内实现抑制病毒进入细胞的效果。

断粮草——抑制病毒的蛋白酶活性

只有木瓜样蛋白酶和3C样蛋白酶这两种有切割作用的“非结构蛋白”,才能产生有复制和转录活性的RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)。RdRp对病毒的复制和扩增最为关键。所以,抑制这两种蛋白酶的活性也会阻碍我的增殖。最近,饶子和院士团队解析了我的3C样蛋白酶的晶体结构,对于开发相应的抑制剂具有巨大推动作用。

以假乱真——抑制病毒的RdRp活性

RdRp是我基因组RNA复制的发动机。而人类在化学库中找到一类和核苷酸(NTP)长得非常像的分子,称之为核苷酸类似物。该类化合物由于和NTP长得非常像,所以可以“欺骗”我的RdRP,代替NTP和RdRP结合,插入到正在合成的RNA链中,最终导致RNA合成提前终止。

瑞德西韦(Remdesivir)就是这类化合物。这个化合物是由美国一家公司研发,对多种RNA病毒的RdRp均有抑制作用。美国北卡罗来纳大学的拉尔夫·巴里可(Ralph Baric)教授发现这个化合物对我“堂哥”MERSCoV和“亲哥”SARS-CoV在動物水平上都有非常好的治疗效果。

为了应对疫情,瑞德西韦治疗新冠肺炎的临床试验在武汉正在进行中。

通过人类这次惨痛的经历,我希望人类认识到,病毒也是大自然家庭的一员。在这个大家庭中,每个物种都有自己的空间。希望每个成员都能彼此尊重,按照大自然的规律和规则相处,建立大自然所有生命的命运共同体。

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