代子诺,何其杰,乔 蕾,何莉娜,黄思艺,赵中权 (西南大学 动物科技学院,重庆 北碚400715)

大量的转录本通常超过200个核苷酸,这些转录本通常是多聚腺苷酸化的,并且没有明显的开放阅读框(ORF),它们被定义为长链非编码RNA(lncRNAs)[1]。lncRNAs参与了许多重要的生理过程,如X 染色体失活、遗传印记、染色质修饰和细胞周期调节[2-3]。由于lncRNAs的功能众多且重要,对于lnc RNAs的进一步探索已成为生物信息学的一个重要方向。

之前的研究已经证实,lnc RNAs在睾丸发育和精子发生中起着重要的调节作用。ANGUERA等[4]的研究结果表明了lncRNAtsx在粗线期精母细胞中有特异性表达,但在精原细胞和圆形精母细胞中不表达。小鼠tsx基因的敲除促进了更多精子的凋亡,证实了其对精子发育中的重要作用。

山羊是人类重要的经济家畜,主要提供肉、奶、羊绒、皮等多种产品。与其他山羊相比,大足黑山羊具有较高的繁殖率。大足黑山羊母羊的平均窝产羔数为2.72只,公山羊具有性成熟早、生长发育快、抗病性强、遗传稳定等特点。

本研究采用高通量测序方法分析了成熟和不成熟山羊睾丸中差异表达的lncRNAs,并对靶基因进行了预测。此外,还对这些靶基因进行了分类注释、GO功能分析和KEGG 通路分析,筛选出了与精子发生有关的候选靶基因及lncRNA。这些数据有助于研究人员深入了解睾丸发育过程以及生殖过程,为进一步了解lncRNAs的功能提供了许多有价值的信息。

1 材料与方法

1.1 试验样品及初情期鉴定方法本研究选取9只大足黑山羊按照年龄平均分为3组。……